More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3512 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 608 aa  1213    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  36.26 
 
 		 613 aa  335  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.57 
 
 		 588 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 		 619 aa  306  9.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  33.62 
 
 		 618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  32.56 
 
 		 609 aa  298  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.9 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.16 
 
 		 596 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.84 
 
 		 602 aa  293  6e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.65 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.59 
 
 		 592 aa  291  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  32.82 
 
 		 610 aa  291  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.92 
 
 		 588 aa  291  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.2 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  32.13 
 
 		 607 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  32.36 
 
 		 596 aa  282  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.22 
 
 		 593 aa  281  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.66 
 
 		 597 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.7 
 
 		 596 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.27 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  31.87 
 
 		 596 aa  277  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  35.2 
 
 		 588 aa  277  5e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  34.04 
 
 		 588 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.71 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  31.8 
 
 		 589 aa  270  7e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  32.29 
 
 		 592 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.13 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.95 
 
 		 622 aa  266  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.89 
 
 		 611 aa  262  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.62 
 
 		 623 aa  261  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  32.96 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 		 598 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.57 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.32 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.98 
 
 		 587 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.91 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.91 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.91 
 
 		 608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.91 
 
 		 608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.74 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.19 
 
 		 630 aa  253  5.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.68 
 
 		 627 aa  253  6e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.19 
 
 		 610 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.19 
 
 		 610 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  31.08 
 
 		 610 aa  252  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  29.42 
 
 		 593 aa  249  9e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.35 
 
 		 613 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.57 
 
 		 610 aa  249  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.32 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.18 
 
 		 611 aa  248  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.32 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.32 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.32 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.32 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.32 
 
 		 610 aa  247  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.56 
 
 		 591 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.42 
 
 		 616 aa  245  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.32 
 
 		 610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.16 
 
 		 610 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.18 
 
 		 624 aa  244  5e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.13 
 
 		 612 aa  244  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  30.91 
 
 		 592 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.07 
 
 		 592 aa  243  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  30.91 
 
 		 592 aa  243  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.89 
 
 		 619 aa  242  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.03 
 
 		 605 aa  243  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.34 
 
 		 594 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.98 
 
 		 606 aa  240  5.999999999999999e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.64 
 
 		 610 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.31 
 
 		 618 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.32 
 
 		 609 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.19 
 
 		 592 aa  231  3e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  31.88 
 
 		 591 aa  231  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.91 
 
 		 619 aa  227  6e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  32.25 
 
 		 599 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.29 
 
 		 609 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  27.96 
 
 		 632 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  32.8 
 
 		 574 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  30.87 
 
 		 622 aa  223  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.69 
 
 		 609 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.57 
 
 		 609 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.16 
 
 		 588 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.85 
 
 		 614 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.97 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.91 
 
 		 634 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  30.1 
 
 		 591 aa  216  9e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.33 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.65 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.19 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.34 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30 
 
 		 609 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.29 
 
 		 620 aa  213  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  26.98 
 
 		 613 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  30.29 
 
 		 574 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 574 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.52 
 
 		 616 aa  210  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  31.26 
 
 		 574 aa  210  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  30.86 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>