More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0656 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 592 aa  1163    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  64.9 
 
 		 592 aa  736    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  92.91 
 
 		 592 aa  1060    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  61.78 
 
 		 593 aa  719    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  63.51 
 
 		 592 aa  741    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  63.27 
 
 		 599 aa  689    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  58.28 
 
 		 592 aa  697    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  99.66 
 
 		 592 aa  1160    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  64.9 
 
 		 592 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  42.86 
 
 		 596 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  43.8 
 
 		 596 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  41.39 
 
 		 599 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.39 
 
 		 598 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  33.99 
 
 		 624 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  36.38 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.13 
 
 		 596 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.98 
 
 		 596 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  33.1 
 
 		 597 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.15 
 
 		 596 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.97 
 
 		 602 aa  340  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.48 
 
 		 588 aa  329  7e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 607 aa  326  7e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.01 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.07 
 
 		 592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  33.78 
 
 		 591 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  34.4 
 
 		 589 aa  303  5.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.59 
 
 		 608 aa  303  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.09 
 
 		 622 aa  300  6e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.65 
 
 		 588 aa  290  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.01 
 
 		 609 aa  289  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  35.42 
 
 		 581 aa  284  4.0000000000000003e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.42 
 
 		 627 aa  281  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.6 
 
 		 609 aa  278  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.8 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.92 
 
 		 601 aa  278  3e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.41 
 
 		 618 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.92 
 
 		 605 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  35.19 
 
 		 618 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.55 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.78 
 
 		 605 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.02 
 
 		 612 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.5 
 
 		 616 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 		 588 aa  273  6e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.32 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.48 
 
 		 613 aa  269  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.7 
 
 		 592 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.83 
 
 		 609 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.12 
 
 		 605 aa  266  7e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.14 
 
 		 609 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.98 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.23 
 
 		 606 aa  263  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.77 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  31.41 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.51 
 
 		 591 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.6 
 
 		 630 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.6 
 
 		 610 aa  254  3e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.07 
 
 		 609 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.11 
 
 		 609 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.91 
 
 		 609 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  27.41 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.95 
 
 		 619 aa  248  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.66 
 
 		 609 aa  247  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  27.24 
 
 		 602 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.31 
 
 		 610 aa  243  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 		 588 aa  243  9e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  27.06 
 
 		 602 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.72 
 
 		 611 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.59 
 
 		 616 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.48 
 
 		 610 aa  241  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.43 
 
 		 619 aa  241  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  28.17 
 
 		 602 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.15 
 
 		 608 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.15 
 
 		 608 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.15 
 
 		 608 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.15 
 
 		 608 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.15 
 
 		 608 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.31 
 
 		 610 aa  237  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  29.06 
 
 		 621 aa  237  6e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.49 
 
 		 610 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.31 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.31 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.31 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.31 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.66 
 
 		 610 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.31 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.12 
 
 		 610 aa  234  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29 
 
 		 614 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.14 
 
 		 610 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.26 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  33.4 
 
 		 583 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.54 
 
 		 574 aa  231  3e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 		 574 aa  229  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 		 605 aa  229  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  31.16 
 
 		 574 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.24 
 
 		 634 aa  227  5.0000000000000005e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  31.05 
 
 		 611 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.51 
 
 		 588 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>