More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1645 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  100 
 
 
606 aa  1176    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  57.95 
 
 
593 aa  685    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  57 
 
 
605 aa  671    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  49.92 
 
 
594 aa  593  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  44.26 
 
 
593 aa  499  1e-140  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  43.91 
 
 
620 aa  498  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  45.79 
 
 
588 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  47.1 
 
 
614 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  46.86 
 
 
632 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  41.69 
 
 
590 aa  482  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  41.36 
 
 
590 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  44.82 
 
 
641 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  41.68 
 
 
591 aa  461  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  40.43 
 
 
588 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  41.91 
 
 
591 aa  442  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  44.98 
 
 
591 aa  439  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  43.16 
 
 
593 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  39.93 
 
 
588 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  41.68 
 
 
586 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  43.99 
 
 
593 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  41.25 
 
 
590 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  39.5 
 
 
590 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  41.02 
 
 
590 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  41.3 
 
 
619 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  40.43 
 
 
594 aa  409  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  43.56 
 
 
592 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  40.59 
 
 
593 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  42.08 
 
 
591 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  40.5 
 
 
587 aa  398  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  39.41 
 
 
591 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  35.91 
 
 
588 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  41.34 
 
 
584 aa  333  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.39 
 
 
623 aa  324  3e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.02 
 
 
613 aa  309  1.0000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.44 
 
 
622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.57 
 
 
596 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.68 
 
 
602 aa  307  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  35.36 
 
 
627 aa  303  7.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.57 
 
 
612 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.35 
 
 
597 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.08 
 
 
609 aa  298  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.81 
 
 
596 aa  293  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30.81 
 
 
596 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.28 
 
 
588 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  32.94 
 
 
580 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 
592 aa  263  6.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.8 
 
 
616 aa  262  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  32.55 
 
 
581 aa  260  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.99 
 
 
609 aa  259  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.61 
 
 
610 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.99 
 
 
593 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.16 
 
 
611 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 
598 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.38 
 
 
608 aa  258  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.45 
 
 
610 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.18 
 
 
630 aa  256  9e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.79 
 
 
610 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 
592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.27 
 
 
609 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 
592 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.66 
 
 
620 aa  248  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.42 
 
 
609 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.53 
 
 
610 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.01 
 
 
618 aa  247  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  31.24 
 
 
600 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.16 
 
 
609 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.52 
 
 
613 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.92 
 
 
613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30 
 
 
609 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.95 
 
 
610 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.91 
 
 
621 aa  243  6e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.79 
 
 
610 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.79 
 
 
610 aa  243  9e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.79 
 
 
610 aa  243  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.79 
 
 
610 aa  243  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.79 
 
 
610 aa  243  9e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.42 
 
 
589 aa  242  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.62 
 
 
608 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.82 
 
 
616 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.57 
 
 
619 aa  240  4e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.56 
 
 
618 aa  241  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.73 
 
 
596 aa  239  8e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  31.1 
 
 
612 aa  239  8e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.63 
 
 
610 aa  239  8e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.48 
 
 
610 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.32 
 
 
611 aa  238  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.37 
 
 
599 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.66 
 
 
591 aa  236  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.25 
 
 
592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  29.8 
 
 
609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  31.84 
 
 
610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.08 
 
 
592 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.24 
 
 
610 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.63 
 
 
608 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.63 
 
 
608 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  30.34 
 
 
588 aa  233  5e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  30.74 
 
 
604 aa  233  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 
607 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  31.54 
 
 
619 aa  232  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.48 
 
 
608 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>