More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1106 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  100 
 
 		 589 aa  1165    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  48.56 
 
 		 589 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  51.1 
 
 		 588 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  51.36 
 
 		 588 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  51.78 
 
 		 588 aa  556  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  48.48 
 
 		 588 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  46.69 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  47.88 
 
 		 587 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  41.72 
 
 		 591 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  41.55 
 
 		 634 aa  402  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  40.13 
 
 		 592 aa  382  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  37.56 
 
 		 622 aa  372  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  38.09 
 
 		 583 aa  360  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  40.98 
 
 		 591 aa  353  5e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  39.27 
 
 		 572 aa  339  5.9999999999999996e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  36.87 
 
 		 593 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 		 575 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.44 
 
 		 598 aa  313  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  36.06 
 
 		 588 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  32.83 
 
 		 575 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  38.96 
 
 		 579 aa  306  8.000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  33.05 
 
 		 575 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  36.17 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 		 575 aa  301  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  34.18 
 
 		 592 aa  301  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  34.18 
 
 		 574 aa  300  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  34.66 
 
 		 597 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.73 
 
 		 592 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.4 
 
 		 575 aa  297  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  33.61 
 
 		 602 aa  297  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  33.45 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  33.9 
 
 		 574 aa  296  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.22 
 
 		 593 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  34.4 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.45 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  34.4 
 
 		 592 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.32 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  32.66 
 
 		 596 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 		 574 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.9 
 
 		 616 aa  286  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  33.16 
 
 		 575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  35.21 
 
 		 599 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  33.22 
 
 		 574 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  36.12 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  33.86 
 
 		 574 aa  278  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  35.29 
 
 		 574 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  32.27 
 
 		 575 aa  278  3e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  41.7 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.03 
 
 		 592 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  37.73 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  36.73 
 
 		 583 aa  272  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.8 
 
 		 608 aa  270  7e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  32.21 
 
 		 575 aa  269  8e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  36.12 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.86 
 
 		 623 aa  269  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.19 
 
 		 622 aa  269  1e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  36.12 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 607 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.39 
 
 		 592 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  34.74 
 
 		 599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.39 
 
 		 592 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  35.79 
 
 		 574 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  31.97 
 
 		 574 aa  266  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  33.84 
 
 		 596 aa  266  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.44 
 
 		 601 aa  265  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.67 
 
 		 605 aa  264  4e-69  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  35.13 
 
 		 618 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.43 
 
 		 588 aa  256  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.45 
 
 		 613 aa  250  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  30.63 
 
 		 624 aa  249  8e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.16 
 
 		 627 aa  246  6.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.31 
 
 		 612 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.97 
 
 		 605 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.31 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.65 
 
 		 602 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.23 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.57 
 
 		 605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.23 
 
 		 606 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  34.62 
 
 		 618 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  28.97 
 
 		 609 aa  230  5e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.06 
 
 		 602 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.64 
 
 		 609 aa  226  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  31.66 
 
 		 632 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  31.36 
 
 		 619 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  27.6 
 
 		 613 aa  224  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  30.83 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 		 593 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.04 
 
 		 641 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.91 
 
 		 608 aa  218  4e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  30.63 
 
 		 602 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.18 
 
 		 605 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  30.54 
 
 		 469 aa  214  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  29.72 
 
 		 600 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  30.99 
 
 		 596 aa  213  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.8 
 
 		 609 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.38 
 
 		 614 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>