More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_14360 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  60.49 
 
 		 610 aa  719    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  60.49 
 
 		 610 aa  719    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  70 
 
 		 609 aa  827    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  60.16 
 
 		 610 aa  716    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  60.98 
 
 		 608 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  66.23 
 
 		 610 aa  785    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  60.49 
 
 		 610 aa  719    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  66.39 
 
 		 610 aa  801    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  66.23 
 
 		 630 aa  801    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  60.98 
 
 		 608 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  60.33 
 
 		 610 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  70 
 
 		 609 aa  828    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  62.3 
 
 		 611 aa  753    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  60.49 
 
 		 610 aa  719    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  65.9 
 
 		 619 aa  766    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  60.98 
 
 		 608 aa  721    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  66.56 
 
 		 610 aa  803    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  60.33 
 
 		 610 aa  716    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  60.49 
 
 		 610 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  100 
 
 		 610 aa  1198    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  67.93 
 
 		 610 aa  802    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  70.16 
 
 		 609 aa  842    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  60.66 
 
 		 608 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  66.07 
 
 		 609 aa  707    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  56.23 
 
 		 609 aa  657    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  62.3 
 
 		 610 aa  731    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  69.67 
 
 		 609 aa  840    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  99.18 
 
 		 610 aa  1191    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  64.91 
 
 		 611 aa  752    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  60.49 
 
 		 610 aa  719    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  60.66 
 
 		 608 aa  717    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  52.44 
 
 		 620 aa  633  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  53.96 
 
 		 627 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  47.55 
 
 		 613 aa  534  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  45.53 
 
 		 612 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  45.42 
 
 		 609 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  37.82 
 
 		 616 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  37.46 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  38.51 
 
 		 609 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  37.96 
 
 		 621 aa  363  7.0000000000000005e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  36.41 
 
 		 588 aa  355  1e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  34.09 
 
 		 600 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  39.09 
 
 		 545 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.6 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  36.44 
 
 		 612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  31.86 
 
 		 604 aa  267  4e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.93 
 
 		 622 aa  265  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  30.69 
 
 		 613 aa  261  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  33.01 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  32.22 
 
 		 612 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.64 
 
 		 602 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.64 
 
 		 596 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  34.52 
 
 		 605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.56 
 
 		 627 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  31.17 
 
 		 632 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 		 592 aa  249  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.43 
 
 		 596 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.55 
 
 		 596 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.88 
 
 		 592 aa  243  9e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.74 
 
 		 588 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.36 
 
 		 589 aa  242  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.01 
 
 		 605 aa  241  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.26 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 588 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.47 
 
 		 608 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  32.31 
 
 		 614 aa  236  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  28.8 
 
 		 650 aa  236  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.47 
 
 		 591 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.97 
 
 		 608 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.03 
 
 		 592 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 		 592 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.23 
 
 		 623 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  31.39 
 
 		 604 aa  231  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 		 613 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.9 
 
 		 581 aa  230  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  29.71 
 
 		 595 aa  229  9e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  28.35 
 
 		 627 aa  228  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.82 
 
 		 593 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.05 
 
 		 588 aa  226  1e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  29.97 
 
 		 593 aa  225  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  31.52 
 
 		 620 aa  224  2e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.22 
 
 		 593 aa  223  6e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.27 
 
 		 624 aa  223  9e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.66 
 
 		 587 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  30.62 
 
 		 608 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.5 
 
 		 593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.65 
 
 		 616 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  31.01 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 		 591 aa  221  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.37 
 
 		 606 aa  221  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  35.04 
 
 		 600 aa  220  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.64 
 
 		 599 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  28.29 
 
 		 594 aa  217  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.67 
 
 		 596 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  27.99 
 
 		 641 aa  216  7e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.92 
 
 		 591 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  30.05 
 
 		 615 aa  215  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.91 
 
 		 598 aa  214  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  29.62 
 
 		 620 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>