More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2399 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 608 aa  1201    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  47.09 
 
 		 613 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  46.46 
 
 		 612 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  44.01 
 
 		 650 aa  448  1.0000000000000001e-124  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  41.82 
 
 		 627 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  40.99 
 
 		 620 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  37.01 
 
 		 595 aa  362  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  33.33 
 
 		 620 aa  306  9.000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  34.23 
 
 		 615 aa  301  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.5 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  33.17 
 
 		 620 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 620 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.53 
 
 		 613 aa  289  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.88 
 
 		 609 aa  286  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.6 
 
 		 602 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.46 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.6 
 
 		 596 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.68 
 
 		 597 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.39 
 
 		 592 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.6 
 
 		 588 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.9 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.21 
 
 		 610 aa  248  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.74 
 
 		 596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.83 
 
 		 611 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.62 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  28.27 
 
 		 604 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.93 
 
 		 610 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.77 
 
 		 630 aa  238  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.45 
 
 		 608 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.26 
 
 		 619 aa  237  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  27.77 
 
 		 610 aa  236  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  28.18 
 
 		 611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.78 
 
 		 610 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.54 
 
 		 605 aa  234  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.73 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.58 
 
 		 620 aa  229  8e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.24 
 
 		 619 aa  229  9e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.33 
 
 		 609 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.05 
 
 		 610 aa  224  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.41 
 
 		 593 aa  223  7e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  30.02 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  28.89 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  28.89 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.89 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  28.89 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  28.89 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  30.02 
 
 		 610 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.69 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  28.73 
 
 		 610 aa  217  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.92 
 
 		 623 aa  216  8e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  29.76 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  29.76 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  29.76 
 
 		 608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  28.1 
 
 		 610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  29.76 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.34 
 
 		 609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  29.76 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.45 
 
 		 594 aa  213  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  29.33 
 
 		 627 aa  213  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.69 
 
 		 621 aa  212  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.46 
 
 		 627 aa  211  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  29.08 
 
 		 593 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  27.6 
 
 		 596 aa  209  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.49 
 
 		 581 aa  209  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.09 
 
 		 616 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.73 
 
 		 593 aa  207  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.38 
 
 		 632 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  26.84 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.78 
 
 		 641 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  29.7 
 
 		 609 aa  203  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.5 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.76 
 
 		 616 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.5 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.51 
 
 		 590 aa  201  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  28.2 
 
 		 591 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.17 
 
 		 590 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  26.89 
 
 		 609 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.83 
 
 		 593 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.66 
 
 		 614 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.1 
 
 		 588 aa  190  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.67 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  29.02 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.13 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  26.78 
 
 		 605 aa  188  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  26.78 
 
 		 605 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  26.97 
 
 		 605 aa  186  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 588 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  27.97 
 
 		 618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  28.22 
 
 		 592 aa  183  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  25.46 
 
 		 592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  27.94 
 
 		 600 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  27.65 
 
 		 606 aa  181  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  25.82 
 
 		 591 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  28.23 
 
 		 603 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  29.12 
 
 		 609 aa  180  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  29.2 
 
 		 545 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  27.45 
 
 		 591 aa  177  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  27.48 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  23.85 
 
 		 591 aa  177  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>