236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3192 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  81.43 
 
 		 620 aa  1003    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 615 aa  1224    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  87.48 
 
 		 620 aa  1068    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  81.6 
 
 		 620 aa  1007    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  40.13 
 
 		 613 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  40.54 
 
 		 627 aa  429  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  38.62 
 
 		 612 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  38.98 
 
 		 650 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  37.89 
 
 		 620 aa  356  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  34.23 
 
 		 608 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  32.05 
 
 		 595 aa  276  8e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.06 
 
 		 596 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.9 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.99 
 
 		 609 aa  238  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.96 
 
 		 596 aa  237  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.64 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.33 
 
 		 613 aa  233  8.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.31 
 
 		 597 aa  230  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.98 
 
 		 588 aa  229  9e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.06 
 
 		 588 aa  228  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.03 
 
 		 616 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.22 
 
 		 622 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.02 
 
 		 612 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.15 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.48 
 
 		 604 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.29 
 
 		 609 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.88 
 
 		 619 aa  214  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 		 592 aa  213  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.46 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  28.96 
 
 		 610 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.55 
 
 		 620 aa  203  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.57 
 
 		 623 aa  201  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  27.61 
 
 		 609 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.2 
 
 		 609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.78 
 
 		 621 aa  199  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  26.83 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.36 
 
 		 609 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  26.88 
 
 		 610 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.43 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.56 
 
 		 618 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  26.49 
 
 		 616 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.27 
 
 		 610 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.43 
 
 		 610 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.13 
 
 		 632 aa  189  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.1 
 
 		 605 aa  188  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  28.57 
 
 		 627 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  26.21 
 
 		 593 aa  186  8e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.77 
 
 		 608 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  26.72 
 
 		 610 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  25.9 
 
 		 588 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  26.72 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  26.72 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  26.72 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  26.72 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  26.72 
 
 		 610 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  24.41 
 
 		 611 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  25.49 
 
 		 605 aa  180  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  26.56 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  26.45 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  26.41 
 
 		 610 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  24.92 
 
 		 608 aa  178  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.02 
 
 		 610 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  26.04 
 
 		 610 aa  177  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  25.2 
 
 		 594 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  26.49 
 
 		 589 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 		 593 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  27.8 
 
 		 588 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.26 
 
 		 593 aa  176  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  25.21 
 
 		 590 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  25.87 
 
 		 609 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  26.6 
 
 		 587 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  26.55 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  26.39 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  26.39 
 
 		 608 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  25.24 
 
 		 611 aa  170  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  28.64 
 
 		 609 aa  170  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  26.23 
 
 		 608 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  26.23 
 
 		 608 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  27.54 
 
 		 614 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  25.24 
 
 		 606 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  28.37 
 
 		 593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  26.36 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  26.66 
 
 		 581 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  26.2 
 
 		 619 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  26.86 
 
 		 588 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  25.38 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  27.2 
 
 		 591 aa  161  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  26.86 
 
 		 588 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  26.92 
 
 		 596 aa  160  7e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  26.45 
 
 		 592 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  26.45 
 
 		 592 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  25.08 
 
 		 601 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  24.27 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  26.12 
 
 		 586 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  27.29 
 
 		 591 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  24.1 
 
 		 590 aa  156  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  25.12 
 
 		 591 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  27.2 
 
 		 592 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  26.96 
 
 		 591 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  28.55 
 
 		 592 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>