255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01839 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  100 
 
 		 620 aa  1233    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  84.6 
 
 		 620 aa  1044    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  87.48 
 
 		 615 aa  1061    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  84.76 
 
 		 620 aa  1048    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  39.01 
 
 		 613 aa  445  1e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  39.59 
 
 		 627 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  38.18 
 
 		 650 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  36.86 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  37.82 
 
 		 620 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 		 608 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  31.35 
 
 		 595 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.72 
 
 		 596 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.72 
 
 		 602 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.22 
 
 		 596 aa  243  9e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.88 
 
 		 596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.67 
 
 		 609 aa  237  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.27 
 
 		 613 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.57 
 
 		 588 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.73 
 
 		 597 aa  228  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.27 
 
 		 588 aa  226  7e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.86 
 
 		 609 aa  223  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  27.35 
 
 		 609 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.28 
 
 		 616 aa  216  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  29.78 
 
 		 604 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.16 
 
 		 612 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.11 
 
 		 619 aa  213  1e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  26.8 
 
 		 622 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.2 
 
 		 620 aa  203  6e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.04 
 
 		 610 aa  203  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  28.89 
 
 		 610 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.03 
 
 		 609 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.03 
 
 		 609 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.07 
 
 		 605 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  27.45 
 
 		 609 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  26.96 
 
 		 610 aa  200  7.999999999999999e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.92 
 
 		 608 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  27.57 
 
 		 623 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.23 
 
 		 621 aa  194  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  25.67 
 
 		 611 aa  193  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  25.94 
 
 		 588 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  26.22 
 
 		 627 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  28.59 
 
 		 627 aa  191  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  26.96 
 
 		 608 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.05 
 
 		 630 aa  190  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  25.89 
 
 		 610 aa  190  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.05 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  26.8 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  26.74 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  26.8 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  26.8 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  26.8 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  26.8 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  26.8 
 
 		 610 aa  187  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  27.94 
 
 		 632 aa  188  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.45 
 
 		 618 aa  187  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.13 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  26.66 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  26.65 
 
 		 610 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  26.49 
 
 		 610 aa  184  6e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  25.93 
 
 		 616 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  25.67 
 
 		 606 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  24.84 
 
 		 611 aa  178  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  25.29 
 
 		 610 aa  178  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  24.96 
 
 		 605 aa  177  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  28.66 
 
 		 609 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  25.58 
 
 		 609 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  25.53 
 
 		 590 aa  175  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  28.27 
 
 		 593 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  25.95 
 
 		 608 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  25.79 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  25.79 
 
 		 608 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  27.97 
 
 		 614 aa  174  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  25.16 
 
 		 594 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  26.22 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.23 
 
 		 593 aa  172  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  25.63 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  25.63 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  25.48 
 
 		 591 aa  170  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  25.79 
 
 		 593 aa  170  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  25.93 
 
 		 593 aa  170  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  26.26 
 
 		 588 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  25.58 
 
 		 589 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  28.2 
 
 		 591 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  24.96 
 
 		 620 aa  167  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  26.71 
 
 		 591 aa  167  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  25.29 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  26.73 
 
 		 581 aa  164  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  26.89 
 
 		 593 aa  163  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  26.32 
 
 		 586 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  26.81 
 
 		 592 aa  161  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  25.91 
 
 		 605 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  25.76 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  25 
 
 		 596 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  27.02 
 
 		 590 aa  157  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  24.1 
 
 		 590 aa  157  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 		 594 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  25.8 
 
 		 641 aa  156  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>