286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0357 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  100 
 
 		 595 aa  1164    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  39.21 
 
 		 613 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  37.7 
 
 		 627 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  38.85 
 
 		 612 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  37.38 
 
 		 608 aa  356  8.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  38.42 
 
 		 650 aa  351  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  37.58 
 
 		 620 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  32.52 
 
 		 620 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 		 620 aa  287  4e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  31.38 
 
 		 620 aa  283  9e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  31.71 
 
 		 615 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.52 
 
 		 609 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  32.73 
 
 		 612 aa  266  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  32.2 
 
 		 613 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.85 
 
 		 630 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.42 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.85 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.68 
 
 		 610 aa  258  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.8 
 
 		 588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.58 
 
 		 610 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.26 
 
 		 610 aa  253  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.42 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.42 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.42 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.42 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.42 
 
 		 610 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.33 
 
 		 610 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.59 
 
 		 592 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.26 
 
 		 610 aa  246  9e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.1 
 
 		 610 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.62 
 
 		 602 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  29.61 
 
 		 604 aa  242  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.16 
 
 		 608 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.29 
 
 		 596 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30 
 
 		 608 aa  242  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.54 
 
 		 610 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  31.5 
 
 		 619 aa  241  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30 
 
 		 608 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30 
 
 		 608 aa  241  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  27.71 
 
 		 621 aa  240  5.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.87 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 		 605 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.38 
 
 		 596 aa  236  9e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.71 
 
 		 610 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.27 
 
 		 608 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.14 
 
 		 609 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.22 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.5 
 
 		 611 aa  230  6e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.55 
 
 		 610 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.24 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.41 
 
 		 596 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  30.21 
 
 		 609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.53 
 
 		 620 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.09 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.06 
 
 		 616 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.16 
 
 		 609 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.71 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.71 
 
 		 609 aa  218  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  28.89 
 
 		 627 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.09 
 
 		 611 aa  212  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  26.87 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  27.76 
 
 		 590 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  26.71 
 
 		 622 aa  208  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.58 
 
 		 590 aa  207  4e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.45 
 
 		 593 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  27.88 
 
 		 623 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.48 
 
 		 632 aa  204  5e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  29.94 
 
 		 604 aa  201  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.57 
 
 		 605 aa  199  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.65 
 
 		 581 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  27.7 
 
 		 627 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  31.55 
 
 		 545 aa  196  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  28.11 
 
 		 616 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.05 
 
 		 588 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.64 
 
 		 588 aa  194  4e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.91 
 
 		 586 aa  194  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.28 
 
 		 614 aa  194  5e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  28.36 
 
 		 609 aa  192  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  25.55 
 
 		 601 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.7 
 
 		 588 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  29.39 
 
 		 589 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  29.15 
 
 		 605 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  27.55 
 
 		 618 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  24.08 
 
 		 591 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  25.86 
 
 		 593 aa  184  5.0000000000000004e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  27.08 
 
 		 641 aa  184  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.32 
 
 		 589 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  25.21 
 
 		 605 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  27.06 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  29.27 
 
 		 596 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  28.76 
 
 		 609 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 		 592 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  29.75 
 
 		 587 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  25.85 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  25.47 
 
 		 592 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  26.33 
 
 		 592 aa  177  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  25.68 
 
 		 594 aa  177  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  26.33 
 
 		 592 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  28.43 
 
 		 609 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>