More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1349 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  100 
 
 		 609 aa  1215    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  39.9 
 
 		 609 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  39.3 
 
 		 609 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  39.56 
 
 		 609 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  39.39 
 
 		 609 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  38.24 
 
 		 630 aa  411  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  37.9 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  37.9 
 
 		 610 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  38.94 
 
 		 610 aa  405  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  37.44 
 
 		 609 aa  404  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  37.87 
 
 		 610 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  37.03 
 
 		 611 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  38.19 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  38.68 
 
 		 610 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  38.35 
 
 		 610 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  38.36 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  36.42 
 
 		 610 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  34.9 
 
 		 613 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  39.22 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  36.33 
 
 		 609 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  37.33 
 
 		 608 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  37.5 
 
 		 608 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  37.5 
 
 		 608 aa  369  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  37.33 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  37.33 
 
 		 608 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  36.42 
 
 		 610 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  36.42 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  36.42 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  36.42 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  36.42 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  36.42 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  35.78 
 
 		 610 aa  362  8e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  36.42 
 
 		 610 aa  362  8e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  36.27 
 
 		 612 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  36.26 
 
 		 610 aa  360  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  36.92 
 
 		 627 aa  355  1e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  34.42 
 
 		 620 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  32.96 
 
 		 619 aa  352  1e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  32.52 
 
 		 616 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  32.79 
 
 		 621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.84 
 
 		 588 aa  316  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  31.22 
 
 		 604 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  35.29 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.26 
 
 		 602 aa  269  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.43 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.67 
 
 		 596 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  29.02 
 
 		 600 aa  261  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.78 
 
 		 596 aa  260  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30.05 
 
 		 591 aa  253  7e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.85 
 
 		 597 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.36 
 
 		 608 aa  250  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  28.06 
 
 		 613 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  30.62 
 
 		 605 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  28.99 
 
 		 595 aa  243  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.92 
 
 		 592 aa  240  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 		 593 aa  239  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  28.64 
 
 		 616 aa  238  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 		 605 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 		 593 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  28.05 
 
 		 627 aa  234  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  27.56 
 
 		 612 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  29.38 
 
 		 612 aa  233  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.93 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  26.52 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.87 
 
 		 589 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  26.59 
 
 		 622 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  28.9 
 
 		 588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.13 
 
 		 593 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  26.26 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  27.78 
 
 		 606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  29.71 
 
 		 581 aa  217  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.42 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  27.19 
 
 		 596 aa  217  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.35 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  25.41 
 
 		 632 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  27.1 
 
 		 608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  28.31 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  28.2 
 
 		 620 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  27.2 
 
 		 605 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  28.38 
 
 		 601 aa  213  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  27.2 
 
 		 605 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  26.66 
 
 		 604 aa  211  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  27.18 
 
 		 592 aa  211  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  28.5 
 
 		 618 aa  210  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  28.2 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  26.21 
 
 		 589 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  27.58 
 
 		 590 aa  209  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  27.58 
 
 		 590 aa  207  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  27.99 
 
 		 605 aa  207  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  27.17 
 
 		 620 aa  206  8e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  27.17 
 
 		 620 aa  206  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  26.39 
 
 		 592 aa  206  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  28.08 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  27.69 
 
 		 590 aa  205  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  26.19 
 
 		 650 aa  204  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.78 
 
 		 593 aa  203  7e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  27.92 
 
 		 588 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  28.48 
 
 		 619 aa  200  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>