More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3754 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  91.48 
 
 		 619 aa  1009    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  61.53 
 
 		 588 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  92.2 
 
 		 590 aa  1030    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  61.69 
 
 		 588 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  64.53 
 
 		 593 aa  757    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 590 aa  1169    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  63.9 
 
 		 586 aa  742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  58.61 
 
 		 593 aa  664    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  63.96 
 
 		 591 aa  772    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  57.94 
 
 		 593 aa  621  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  54.31 
 
 		 591 aa  569  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  51.78 
 
 		 587 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  54.15 
 
 		 591 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  47.97 
 
 		 594 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  41.32 
 
 		 593 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  40.69 
 
 		 606 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  41.36 
 
 		 588 aa  419  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  39.02 
 
 		 594 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  40.72 
 
 		 632 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  38.47 
 
 		 590 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  38.47 
 
 		 590 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  39.35 
 
 		 593 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  39 
 
 		 605 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  40.55 
 
 		 614 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  37.34 
 
 		 620 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  36.82 
 
 		 591 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  36.15 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  37.36 
 
 		 641 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  37.42 
 
 		 591 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  37.67 
 
 		 592 aa  347  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.86 
 
 		 588 aa  313  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  32.15 
 
 		 596 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  32.02 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  36.6 
 
 		 584 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.21 
 
 		 597 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.92 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.81 
 
 		 627 aa  265  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.57 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30.74 
 
 		 596 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.57 
 
 		 596 aa  261  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  32.47 
 
 		 580 aa  259  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.82 
 
 		 592 aa  253  9.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.19 
 
 		 613 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.91 
 
 		 612 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.84 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.19 
 
 		 592 aa  244  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.9 
 
 		 609 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.47 
 
 		 619 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  32.74 
 
 		 581 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.31 
 
 		 611 aa  238  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.69 
 
 		 618 aa  237  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.77 
 
 		 593 aa  236  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.01 
 
 		 592 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.01 
 
 		 592 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30.81 
 
 		 591 aa  234  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 592 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.07 
 
 		 610 aa  232  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.07 
 
 		 630 aa  232  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.95 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.13 
 
 		 609 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.9 
 
 		 610 aa  230  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.13 
 
 		 609 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.38 
 
 		 621 aa  229  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  28.94 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.68 
 
 		 591 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.41 
 
 		 592 aa  227  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  32.84 
 
 		 600 aa  227  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.65 
 
 		 588 aa  226  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.22 
 
 		 609 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.55 
 
 		 616 aa  223  9e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.04 
 
 		 610 aa  220  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.85 
 
 		 599 aa  220  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.63 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.64 
 
 		 620 aa  217  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.32 
 
 		 605 aa  217  5.9999999999999996e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 		 618 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.35 
 
 		 601 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  30.25 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  28.37 
 
 		 611 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  27.67 
 
 		 588 aa  213  5.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  28.57 
 
 		 592 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.05 
 
 		 610 aa  212  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.48 
 
 		 619 aa  212  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.68 
 
 		 589 aa  211  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.32 
 
 		 605 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.28 
 
 		 610 aa  210  5e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.93 
 
 		 609 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.39 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  29.65 
 
 		 588 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  27.21 
 
 		 609 aa  206  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.45 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  29.12 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  29.12 
 
 		 608 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.87 
 
 		 624 aa  204  3e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  29.12 
 
 		 608 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.85 
 
 		 616 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  29.12 
 
 		 608 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  29.12 
 
 		 608 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.45 
 
 		 610 aa  203  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>