More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0659 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  100 
 
 		 619 aa  1234    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  61.33 
 
 		 588 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  56.88 
 
 		 593 aa  639    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  91.48 
 
 		 590 aa  1011    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  64.97 
 
 		 593 aa  761    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  62.76 
 
 		 591 aa  751    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  60.99 
 
 		 588 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  63.03 
 
 		 586 aa  726    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  99.32 
 
 		 590 aa  1149    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  56.03 
 
 		 593 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  52.3 
 
 		 591 aa  544  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  52.81 
 
 		 591 aa  525  1e-148  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  50.09 
 
 		 587 aa  516  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  46.4 
 
 		 594 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  41.95 
 
 		 593 aa  437  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  41.06 
 
 		 606 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  40.92 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  38.31 
 
 		 594 aa  412  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  39.47 
 
 		 632 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  38.23 
 
 		 590 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  38.05 
 
 		 590 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  38.32 
 
 		 593 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  40.43 
 
 		 614 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  36.61 
 
 		 620 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  35.76 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  37.6 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  36.66 
 
 		 641 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  35.65 
 
 		 590 aa  371  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  36.59 
 
 		 591 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  36.67 
 
 		 592 aa  342  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.28 
 
 		 588 aa  303  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  32.53 
 
 		 602 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  32.65 
 
 		 596 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.85 
 
 		 597 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  36.43 
 
 		 584 aa  286  9e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.76 
 
 		 622 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.33 
 
 		 623 aa  267  4e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.93 
 
 		 627 aa  264  3e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.03 
 
 		 596 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.86 
 
 		 596 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  32.24 
 
 		 612 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.1 
 
 		 609 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  32.44 
 
 		 580 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.77 
 
 		 592 aa  251  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.15 
 
 		 592 aa  249  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.42 
 
 		 619 aa  244  3e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.23 
 
 		 593 aa  243  7e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.07 
 
 		 613 aa  243  9e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.94 
 
 		 592 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.58 
 
 		 609 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.94 
 
 		 592 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  31.85 
 
 		 581 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.74 
 
 		 596 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.79 
 
 		 618 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 592 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.51 
 
 		 592 aa  232  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30.69 
 
 		 591 aa  232  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.01 
 
 		 611 aa  231  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.12 
 
 		 588 aa  230  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  30.1 
 
 		 591 aa  229  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 618 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.36 
 
 		 616 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.59 
 
 		 621 aa  223  7e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.17 
 
 		 609 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.33 
 
 		 601 aa  222  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.17 
 
 		 609 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.19 
 
 		 630 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.24 
 
 		 610 aa  220  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.75 
 
 		 605 aa  220  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.75 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.08 
 
 		 610 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.67 
 
 		 599 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.71 
 
 		 610 aa  218  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  31.91 
 
 		 600 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.26 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.47 
 
 		 609 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.5 
 
 		 620 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.49 
 
 		 610 aa  213  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  28.92 
 
 		 592 aa  213  7.999999999999999e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.5 
 
 		 589 aa  213  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.36 
 
 		 609 aa  212  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  28.62 
 
 		 605 aa  212  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.1 
 
 		 609 aa  210  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  28.79 
 
 		 588 aa  209  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  28.28 
 
 		 609 aa  209  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  28.71 
 
 		 611 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.65 
 
 		 610 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.36 
 
 		 619 aa  206  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  28.11 
 
 		 605 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.19 
 
 		 610 aa  206  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.65 
 
 		 610 aa  206  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  29.33 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  29.49 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  29.49 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.49 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  29.49 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  29.49 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  29.25 
 
 		 608 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  29.25 
 
 		 608 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.38 
 
 		 616 aa  204  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>