More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0104 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  100 
 
 
618 aa  1194    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  57.32 
 
 
622 aa  666    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  53.61 
 
 
623 aa  598  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  52.85 
 
 
627 aa  581  1e-164  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  46.79 
 
 
616 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  40.83 
 
 
602 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  40.99 
 
 
596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  40.96 
 
 
597 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  39.87 
 
 
596 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  39.87 
 
 
596 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  38.27 
 
 
588 aa  360  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  37.24 
 
 
588 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  35.14 
 
 
596 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  34.4 
 
 
592 aa  306  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.35 
 
 
609 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  34.77 
 
 
593 aa  303  5.000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.09 
 
 
612 aa  301  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  37.11 
 
 
598 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.99 
 
 
589 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.4 
 
 
613 aa  292  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.67 
 
 
592 aa  291  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  35.46 
 
 
592 aa  290  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.99 
 
 
607 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  34.5 
 
 
589 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  34.34 
 
 
592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.28 
 
 
592 aa  284  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  34.01 
 
 
592 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  31.34 
 
 
591 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.67 
 
 
613 aa  282  2e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  34.28 
 
 
601 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.98 
 
 
594 aa  280  6e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  34.26 
 
 
588 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  34.34 
 
 
605 aa  278  2e-73  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  35.44 
 
 
599 aa  278  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  36.94 
 
 
591 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.72 
 
 
605 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
608 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  31.42 
 
 
624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  32.39 
 
 
605 aa  273  7e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.54 
 
 
609 aa  273  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  33.96 
 
 
602 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.27 
 
 
588 aa  272  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  34.32 
 
 
593 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.4 
 
 
588 aa  272  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.8 
 
 
605 aa  271  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  34.72 
 
 
592 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  33.5 
 
 
609 aa  270  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  34.72 
 
 
592 aa  270  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.99 
 
 
609 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  32.89 
 
 
602 aa  268  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.62 
 
 
609 aa  267  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.89 
 
 
602 aa  267  5e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.83 
 
 
592 aa  266  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  34.19 
 
 
606 aa  264  4e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  33.79 
 
 
602 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  33.05 
 
 
596 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  32.32 
 
 
593 aa  259  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  35.16 
 
 
581 aa  258  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.62 
 
 
606 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.14 
 
 
596 aa  256  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.2 
 
 
588 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  32.41 
 
 
614 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  31.19 
 
 
609 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  31.19 
 
 
609 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.64 
 
 
620 aa  251  3e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.8 
 
 
588 aa  250  6e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  32.03 
 
 
587 aa  249  7e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  30.48 
 
 
613 aa  249  9e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  32.6 
 
 
591 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.33 
 
 
587 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.9 
 
 
619 aa  249  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.9 
 
 
619 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  30.69 
 
 
590 aa  247  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.89 
 
 
588 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.63 
 
 
621 aa  244  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  31.79 
 
 
591 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.75 
 
 
616 aa  243  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  29.28 
 
 
593 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  30.2 
 
 
590 aa  242  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 
618 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  30.56 
 
 
590 aa  240  5e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  30.93 
 
 
612 aa  240  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.5 
 
 
610 aa  240  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.74 
 
 
593 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  30.74 
 
 
622 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  33.99 
 
 
599 aa  238  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  30.82 
 
 
610 aa  239  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29 
 
 
610 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  31.51 
 
 
619 aa  238  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.41 
 
 
632 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29 
 
 
630 aa  237  4e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29 
 
 
610 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.97 
 
 
641 aa  237  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.8 
 
 
588 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  30.39 
 
 
627 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  32.56 
 
 
593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.7 
 
 
611 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.42 
 
 
609 aa  233  7.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  28.71 
 
 
620 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.91 
 
 
610 aa  233  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>