More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0576 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  92.91 
 
 		 592 aa  1061    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  64.38 
 
 		 592 aa  733    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 592 aa  1165    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  61.11 
 
 		 593 aa  706    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  63.68 
 
 		 592 aa  743    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  58.71 
 
 		 592 aa  701    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  92.57 
 
 		 592 aa  1058    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  64.38 
 
 		 592 aa  733    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  63.94 
 
 		 599 aa  699    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  42 
 
 		 596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  43.76 
 
 		 596 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  42.09 
 
 		 599 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  39.56 
 
 		 598 aa  382  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  34.05 
 
 		 624 aa  363  5.0000000000000005e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.99 
 
 		 596 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.15 
 
 		 596 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.81 
 
 		 596 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  33.62 
 
 		 597 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.64 
 
 		 602 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  35.95 
 
 		 588 aa  340  4e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.13 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.5 
 
 		 607 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.95 
 
 		 623 aa  325  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.37 
 
 		 622 aa  312  9e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.68 
 
 		 589 aa  312  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  34.73 
 
 		 589 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  34.19 
 
 		 591 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 		 608 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  34.89 
 
 		 592 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.9 
 
 		 627 aa  294  3e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  35.23 
 
 		 588 aa  293  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  36.1 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.49 
 
 		 609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  35.54 
 
 		 618 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.03 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.85 
 
 		 605 aa  279  8e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.63 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.82 
 
 		 593 aa  276  8e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  32.45 
 
 		 613 aa  275  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.75 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.75 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.23 
 
 		 587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.56 
 
 		 609 aa  273  9e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  34.2 
 
 		 618 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.21 
 
 		 605 aa  270  4e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.1 
 
 		 588 aa  270  5e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.35 
 
 		 612 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.44 
 
 		 616 aa  270  8e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.11 
 
 		 606 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.32 
 
 		 609 aa  266  8e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.84 
 
 		 592 aa  263  4.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  31.16 
 
 		 610 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.33 
 
 		 609 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  27.9 
 
 		 602 aa  252  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.81 
 
 		 616 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.17 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  28.07 
 
 		 602 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  29.22 
 
 		 602 aa  247  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30 
 
 		 610 aa  246  6e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30 
 
 		 630 aa  246  6.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  27.73 
 
 		 602 aa  246  8e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.98 
 
 		 609 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.88 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.87 
 
 		 609 aa  245  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.84 
 
 		 606 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.82 
 
 		 591 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.82 
 
 		 609 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.59 
 
 		 619 aa  241  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 619 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.13 
 
 		 588 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.07 
 
 		 634 aa  238  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.43 
 
 		 611 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.6 
 
 		 614 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 605 aa  233  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.65 
 
 		 588 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  33.4 
 
 		 583 aa  232  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  32.01 
 
 		 574 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.92 
 
 		 610 aa  231  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28.73 
 
 		 621 aa  230  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.19 
 
 		 610 aa  229  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  27.78 
 
 		 588 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  26.27 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.27 
 
 		 574 aa  226  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  28.22 
 
 		 591 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.98 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  29.74 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  27.9 
 
 		 590 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  32.72 
 
 		 574 aa  225  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  28.92 
 
 		 610 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.09 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  27.18 
 
 		 632 aa  223  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  28.85 
 
 		 608 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  28.85 
 
 		 608 aa  223  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  28.92 
 
 		 610 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  28.85 
 
 		 608 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.92 
 
 		 610 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  28.92 
 
 		 610 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  28.85 
 
 		 608 aa  222  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>