More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4947 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  100 
 
 
597 aa  1184    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  63.47 
 
 
596 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  73.99 
 
 
602 aa  919    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  63.3 
 
 
596 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  73.78 
 
 
596 aa  914    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  42.42 
 
 
622 aa  494  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  42.11 
 
 
623 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  41.16 
 
 
627 aa  451  1e-125  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  41.04 
 
 
605 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  40.67 
 
 
605 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  40.87 
 
 
605 aa  445  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  42.3 
 
 
609 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  40.74 
 
 
601 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  40.69 
 
 
616 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  41.02 
 
 
618 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  40.1 
 
 
606 aa  415  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  38.47 
 
 
588 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  39.5 
 
 
602 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  39.77 
 
 
602 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  39.77 
 
 
602 aa  399  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  38.03 
 
 
588 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  40.32 
 
 
602 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  36 
 
 
592 aa  360  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.82 
 
 
598 aa  356  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  36.4 
 
 
596 aa  347  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.57 
 
 
609 aa  336  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.67 
 
 
592 aa  334  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  35.67 
 
 
588 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
592 aa  332  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.16 
 
 
592 aa  331  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  34.29 
 
 
592 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  34.67 
 
 
592 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  34.67 
 
 
592 aa  326  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.92 
 
 
612 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.72 
 
 
591 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  35.36 
 
 
589 aa  320  7e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.76 
 
 
588 aa  320  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  33.94 
 
 
624 aa  319  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 
592 aa  316  6e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 
593 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  30.46 
 
 
619 aa  313  5.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  33.33 
 
 
596 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  34.32 
 
 
599 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  34.34 
 
 
589 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.32 
 
 
592 aa  300  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  32.09 
 
 
593 aa  299  1e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.37 
 
 
591 aa  295  1e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.65 
 
 
581 aa  291  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.45 
 
 
606 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.84 
 
 
608 aa  288  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  35.36 
 
 
587 aa  287  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.59 
 
 
613 aa  287  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.41 
 
 
605 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.5 
 
 
588 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.52 
 
 
616 aa  280  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.24 
 
 
588 aa  280  7e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  31.31 
 
 
594 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  32.56 
 
 
614 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  34.19 
 
 
618 aa  276  7e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  30.16 
 
 
590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  29.69 
 
 
590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  30.76 
 
 
588 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.66 
 
 
611 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  31.29 
 
 
593 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.97 
 
 
634 aa  268  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 
607 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  30.77 
 
 
588 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  32.57 
 
 
609 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.95 
 
 
588 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  31.56 
 
 
590 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.92 
 
 
609 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  31.75 
 
 
590 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  32.04 
 
 
599 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  31.75 
 
 
619 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  29.31 
 
 
621 aa  263  6e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.44 
 
 
583 aa  263  8.999999999999999e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.19 
 
 
610 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.24 
 
 
613 aa  262  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.27 
 
 
609 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.3 
 
 
610 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.19 
 
 
630 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.02 
 
 
610 aa  260  6e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  30.14 
 
 
591 aa  257  5e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.84 
 
 
613 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.63 
 
 
619 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.34 
 
 
632 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  30.96 
 
 
596 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  35.85 
 
 
469 aa  254  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 
591 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  28.64 
 
 
620 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.47 
 
 
622 aa  253  1e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  30.35 
 
 
603 aa  252  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.8 
 
 
611 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  30.57 
 
 
641 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  30.54 
 
 
609 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.36 
 
 
609 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  29.14 
 
 
593 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.36 
 
 
609 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  28.43 
 
 
593 aa  248  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>