More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2162 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  100 
 
 		 590 aa  1162    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  51.76 
 
 		 591 aa  587  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  51.85 
 
 		 591 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  52.69 
 
 		 592 aa  548  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  38.58 
 
 		 593 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  39.49 
 
 		 593 aa  426  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  39.17 
 
 		 606 aa  417  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  38.12 
 
 		 632 aa  412  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  36.85 
 
 		 594 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  38.58 
 
 		 588 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  39.5 
 
 		 591 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  39.87 
 
 		 593 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  40.37 
 
 		 593 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  37.42 
 
 		 641 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  36.5 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  36.89 
 
 		 588 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  36.5 
 
 		 620 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  36.04 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  38.77 
 
 		 614 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  36.99 
 
 		 586 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  36.15 
 
 		 590 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  36.64 
 
 		 593 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  36.7 
 
 		 591 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  35.74 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  36.15 
 
 		 590 aa  362  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  35.76 
 
 		 587 aa  362  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  35.23 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  35.65 
 
 		 619 aa  349  7e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  36.3 
 
 		 594 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  35.51 
 
 		 591 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  33.61 
 
 		 584 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  30.6 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.78 
 
 		 602 aa  261  4e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.6 
 
 		 596 aa  260  5.0000000000000005e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.65 
 
 		 622 aa  248  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  30.52 
 
 		 580 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.47 
 
 		 597 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  27.58 
 
 		 613 aa  240  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.61 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.09 
 
 		 599 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.19 
 
 		 596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.86 
 
 		 623 aa  234  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.83 
 
 		 596 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  29.78 
 
 		 581 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.83 
 
 		 596 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.73 
 
 		 618 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.48 
 
 		 627 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.81 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 		 592 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.15 
 
 		 616 aa  222  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 		 607 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.04 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  28.27 
 
 		 612 aa  216  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.39 
 
 		 592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.2 
 
 		 592 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.3 
 
 		 592 aa  213  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  28.99 
 
 		 609 aa  213  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.21 
 
 		 593 aa  213  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.46 
 
 		 588 aa  212  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  26.6 
 
 		 609 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  26.88 
 
 		 592 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  27.95 
 
 		 598 aa  210  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  28.57 
 
 		 588 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  27.87 
 
 		 592 aa  207  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.55 
 
 		 608 aa  206  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  29.33 
 
 		 592 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 		 592 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  30.35 
 
 		 599 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.7 
 
 		 605 aa  204  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  28.72 
 
 		 601 aa  203  7e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  26.59 
 
 		 609 aa  203  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  28.88 
 
 		 588 aa  203  9e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.26 
 
 		 619 aa  202  9.999999999999999e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  27.02 
 
 		 588 aa  199  9e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.35 
 
 		 613 aa  199  1.0000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  26.3 
 
 		 609 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  28.69 
 
 		 596 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  26.3 
 
 		 609 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  27.06 
 
 		 609 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.02 
 
 		 609 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  26.6 
 
 		 589 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  27.5 
 
 		 589 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.48 
 
 		 608 aa  194  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  27.51 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  28.03 
 
 		 600 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  25.32 
 
 		 610 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  25.08 
 
 		 620 aa  191  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 605 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  24.8 
 
 		 611 aa  190  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  27.81 
 
 		 604 aa  189  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  28.81 
 
 		 591 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  26.72 
 
 		 627 aa  187  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.5 
 
 		 621 aa  187  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  23.79 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  26.97 
 
 		 609 aa  186  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  27.57 
 
 		 588 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  23.79 
 
 		 630 aa  186  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  24.57 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  23.79 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  24.83 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>