289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1803 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  62.76 
 
 		 619 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  58.54 
 
 		 588 aa  667    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  56.25 
 
 		 593 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  63.28 
 
 		 590 aa  716    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  63.85 
 
 		 593 aa  736    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 591 aa  1161    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  64.64 
 
 		 586 aa  749    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  59.22 
 
 		 588 aa  682    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  63.96 
 
 		 590 aa  720    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  55.74 
 
 		 593 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  54.31 
 
 		 591 aa  578  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  53.64 
 
 		 591 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  50.85 
 
 		 587 aa  530  1e-149  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  47.97 
 
 		 594 aa  518  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  43.29 
 
 		 593 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  41.48 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  40.1 
 
 		 590 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  39.33 
 
 		 594 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  39.93 
 
 		 590 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  39.21 
 
 		 593 aa  413  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  41.41 
 
 		 632 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  39.64 
 
 		 605 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  39.12 
 
 		 588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  37.72 
 
 		 620 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  37.58 
 
 		 641 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  39.74 
 
 		 614 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  36.7 
 
 		 590 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  35.24 
 
 		 591 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  36.42 
 
 		 591 aa  347  2e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  35.47 
 
 		 592 aa  332  1e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.52 
 
 		 588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  35.4 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  33.91 
 
 		 580 aa  273  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.38 
 
 		 596 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.24 
 
 		 602 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  34.43 
 
 		 581 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  32.41 
 
 		 612 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.72 
 
 		 597 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.15 
 
 		 622 aa  250  6e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.29 
 
 		 588 aa  249  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.78 
 
 		 611 aa  249  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  29.97 
 
 		 609 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.33 
 
 		 627 aa  239  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.76 
 
 		 610 aa  239  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.9 
 
 		 630 aa  237  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.59 
 
 		 610 aa  236  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  29.56 
 
 		 619 aa  236  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.39 
 
 		 592 aa  236  9e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.17 
 
 		 613 aa  236  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  30.69 
 
 		 609 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.6 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.32 
 
 		 620 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.87 
 
 		 581 aa  225  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.79 
 
 		 588 aa  223  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  27.29 
 
 		 592 aa  223  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.8 
 
 		 611 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  30 
 
 		 591 aa  221  3e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  27.84 
 
 		 605 aa  221  3e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  29.24 
 
 		 618 aa  221  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.83 
 
 		 609 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.78 
 
 		 609 aa  220  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.33 
 
 		 596 aa  220  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.15 
 
 		 588 aa  220  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  29.47 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 		 592 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  29.66 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.99 
 
 		 610 aa  219  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.66 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.09 
 
 		 598 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  26.83 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  30.13 
 
 		 610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  29.97 
 
 		 588 aa  218  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.6 
 
 		 624 aa  216  8e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.8 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.22 
 
 		 592 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.47 
 
 		 607 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.67 
 
 		 593 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.72 
 
 		 588 aa  213  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  30.78 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  28.14 
 
 		 601 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  28.97 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  28.48 
 
 		 599 aa  212  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.59 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.09 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.45 
 
 		 592 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  29.17 
 
 		 619 aa  211  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.45 
 
 		 592 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  29.63 
 
 		 592 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  28.31 
 
 		 604 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.75 
 
 		 618 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  26.84 
 
 		 609 aa  207  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  26.89 
 
 		 592 aa  206  7e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.27 
 
 		 608 aa  206  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  27.6 
 
 		 613 aa  206  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  27.97 
 
 		 613 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.59 
 
 		 610 aa  206  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  29.4 
 
 		 600 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.52 
 
 		 589 aa  204  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.36 
 
 		 608 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.36 
 
 		 608 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>