More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0633 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  100 
 
 		 594 aa  1164    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  51.1 
 
 		 593 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  49.75 
 
 		 606 aa  568  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  48.43 
 
 		 605 aa  525  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  46.19 
 
 		 588 aa  497  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  46.52 
 
 		 593 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  45.63 
 
 		 614 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  43.82 
 
 		 632 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  43.52 
 
 		 590 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  43.34 
 
 		 590 aa  455  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  42.72 
 
 		 620 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  40.78 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  41.58 
 
 		 591 aa  432  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  39.33 
 
 		 591 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  39.36 
 
 		 586 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  38.68 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  38.82 
 
 		 593 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  38.41 
 
 		 588 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  36.85 
 
 		 590 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  40.54 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  38.45 
 
 		 590 aa  389  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  39.02 
 
 		 590 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  41.04 
 
 		 592 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  36.81 
 
 		 593 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  38.84 
 
 		 591 aa  388  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  38.31 
 
 		 619 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  38.76 
 
 		 593 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  37.27 
 
 		 594 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  37.56 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  36.81 
 
 		 591 aa  346  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.65 
 
 		 588 aa  334  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  36.2 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.2 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.85 
 
 		 597 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.51 
 
 		 613 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  32.49 
 
 		 623 aa  275  2.0000000000000002e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.72 
 
 		 602 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.38 
 
 		 596 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.75 
 
 		 627 aa  267  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.78 
 
 		 596 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.74 
 
 		 612 aa  263  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.43 
 
 		 596 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.71 
 
 		 622 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  30.2 
 
 		 598 aa  260  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30 
 
 		 609 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  30.73 
 
 		 619 aa  256  6e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.55 
 
 		 621 aa  255  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  31.84 
 
 		 616 aa  250  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  29.89 
 
 		 616 aa  249  8e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.2 
 
 		 588 aa  243  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.98 
 
 		 618 aa  243  7.999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.34 
 
 		 608 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.23 
 
 		 592 aa  240  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.15 
 
 		 588 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 		 588 aa  237  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.07 
 
 		 610 aa  236  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.07 
 
 		 630 aa  236  1.0000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.29 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.07 
 
 		 610 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  31.83 
 
 		 588 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  29.7 
 
 		 610 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  30.86 
 
 		 580 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  29.97 
 
 		 581 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 		 592 aa  229  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.41 
 
 		 611 aa  227  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  29.28 
 
 		 604 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.55 
 
 		 593 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 		 588 aa  226  9e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.82 
 
 		 624 aa  226  9e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 607 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.17 
 
 		 610 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  29.7 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  29.7 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.01 
 
 		 608 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  29.7 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.7 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  29.7 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.59 
 
 		 599 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.48 
 
 		 581 aa  222  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  29.37 
 
 		 610 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  29.53 
 
 		 610 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  26.96 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  28.4 
 
 		 589 aa  220  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.55 
 
 		 591 aa  220  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  25.87 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.17 
 
 		 609 aa  217  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  30.18 
 
 		 600 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.6 
 
 		 610 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.21 
 
 		 609 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.05 
 
 		 610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  29.13 
 
 		 608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  29.13 
 
 		 608 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  25.9 
 
 		 613 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  25.17 
 
 		 592 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  25.17 
 
 		 592 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.64 
 
 		 620 aa  213  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.74 
 
 		 605 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  28.57 
 
 		 610 aa  212  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  28.96 
 
 		 608 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  29.13 
 
 		 608 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>