More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1684 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  100 
 
 
588 aa  1171    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  65.78 
 
 
587 aa  701    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  67.52 
 
 
588 aa  802    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  51.1 
 
 
589 aa  568  1e-160  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  51.02 
 
 
588 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  51.7 
 
 
588 aa  550  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  48.48 
 
 
589 aa  536  1e-151  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  42.66 
 
 
591 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  44.46 
 
 
588 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  44.73 
 
 
591 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  40.68 
 
 
592 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  39.79 
 
 
634 aa  395  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  38.75 
 
 
583 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  37.39 
 
 
622 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  35.39 
 
 
593 aa  336  9e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  36.71 
 
 
572 aa  327  3e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  38.4 
 
 
574 aa  325  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  37.89 
 
 
574 aa  323  8e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  35.89 
 
 
598 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 
575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  36.38 
 
 
574 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
574 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.72 
 
 
588 aa  303  6.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  35.49 
 
 
574 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  35 
 
 
588 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  36.26 
 
 
607 aa  296  8e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  36.21 
 
 
574 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  33.45 
 
 
574 aa  295  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  36.21 
 
 
574 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  33.11 
 
 
575 aa  288  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  36.35 
 
 
574 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  33.46 
 
 
575 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.34 
 
 
575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  31.89 
 
 
596 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  31.89 
 
 
602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  36.21 
 
 
574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  33.39 
 
 
579 aa  283  8.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  33.84 
 
 
583 aa  283  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  32.87 
 
 
599 aa  283  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  32.94 
 
 
596 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.94 
 
 
596 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  31.92 
 
 
575 aa  280  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  36.38 
 
 
574 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.56 
 
 
597 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  37.09 
 
 
581 aa  279  1e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  33.05 
 
 
596 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  35.15 
 
 
596 aa  276  5e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  32.15 
 
 
575 aa  276  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  35.23 
 
 
592 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  34.04 
 
 
608 aa  276  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  31.76 
 
 
574 aa  274  3e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  32.83 
 
 
575 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  37.07 
 
 
574 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  34.1 
 
 
575 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.95 
 
 
612 aa  269  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.39 
 
 
592 aa  269  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.34 
 
 
609 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  32.2 
 
 
574 aa  268  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.31 
 
 
623 aa  268  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  36.3 
 
 
578 aa  267  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  34.06 
 
 
632 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.64 
 
 
592 aa  259  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.87 
 
 
616 aa  259  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.45 
 
 
592 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.14 
 
 
605 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.84 
 
 
593 aa  258  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  32.64 
 
 
592 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.14 
 
 
605 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.96 
 
 
601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.89 
 
 
605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.85 
 
 
588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  32.1 
 
 
592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  32.85 
 
 
627 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  32.25 
 
 
610 aa  252  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.46 
 
 
613 aa  251  2e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  32.08 
 
 
630 aa  251  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  32.08 
 
 
610 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.55 
 
 
592 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 
592 aa  249  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.76 
 
 
622 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.7 
 
 
609 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.94 
 
 
609 aa  246  6e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  35.64 
 
 
599 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.69 
 
 
624 aa  242  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.01 
 
 
613 aa  242  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  32.82 
 
 
596 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  32.94 
 
 
610 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.15 
 
 
594 aa  238  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  30.44 
 
 
602 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 
618 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  31.91 
 
 
611 aa  236  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.26 
 
 
602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.27 
 
 
602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.44 
 
 
602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.11 
 
 
609 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.93 
 
 
606 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 
593 aa  233  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  32.74 
 
 
614 aa  233  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.78 
 
 
609 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  32.09 
 
 
610 aa  229  8e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>