298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3152 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3152  Citrate transporter  100 
 
 		 580 aa  1124    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3442  Citrate transporter  87.26 
 
 		 581 aa  925    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.739627  normal  0.715274 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  35.93 
 
 		 586 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  34.18 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  33.61 
 
 		 591 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  33.05 
 
 		 588 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3404  TrkA domain-containing protein  36.18 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.61 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  33.9 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  33.61 
 
 		 593 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  33.95 
 
 		 593 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.68 
 
 		 606 aa  259  7e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 614 aa  254  3e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 		 591 aa  253  6e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  30.3 
 
 		 590 aa  250  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  28.17 
 
 		 590 aa  246  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  32.21 
 
 		 590 aa  245  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.99 
 
 		 590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.48 
 
 		 605 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.47 
 
 		 594 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  31.42 
 
 		 632 aa  243  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  31.14 
 
 		 593 aa  243  9e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 594 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  32.1 
 
 		 590 aa  234  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  30.75 
 
 		 641 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  32.3 
 
 		 619 aa  227  4e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  32.49 
 
 		 587 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  29.47 
 
 		 620 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  32.94 
 
 		 591 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.52 
 
 		 588 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.25 
 
 		 581 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  29.55 
 
 		 591 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  29.1 
 
 		 591 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.82 
 
 		 592 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.98 
 
 		 608 aa  183  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29 
 
 		 588 aa  182  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.99 
 
 		 588 aa  180  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  31.26 
 
 		 592 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.95 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.32 
 
 		 596 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.95 
 
 		 592 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.37 
 
 		 602 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.08 
 
 		 592 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.8 
 
 		 622 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.55 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  27.49 
 
 		 609 aa  171  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.44 
 
 		 623 aa  171  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.26 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.86 
 
 		 596 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.48 
 
 		 619 aa  167  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.2 
 
 		 591 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.31 
 
 		 592 aa  166  9e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.08 
 
 		 607 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.27 
 
 		 620 aa  166  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.15 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  28.21 
 
 		 610 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  30.23 
 
 		 592 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 		 592 aa  165  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  26.94 
 
 		 624 aa  163  8.000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.63 
 
 		 627 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  27.38 
 
 		 609 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.31 
 
 		 608 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  27.57 
 
 		 588 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.24 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  28.23 
 
 		 612 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.42 
 
 		 610 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.42 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  27.42 
 
 		 609 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  27.05 
 
 		 589 aa  160  8e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  27.64 
 
 		 612 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.42 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  27.79 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.41 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  27.79 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  27.79 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  27.79 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  27.42 
 
 		 609 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  27.14 
 
 		 588 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.79 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  27.79 
 
 		 610 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  30.17 
 
 		 599 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.52 
 
 		 621 aa  157  6e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  28.6 
 
 		 589 aa  157  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  29.85 
 
 		 610 aa  156  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  28.07 
 
 		 600 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  27.87 
 
 		 610 aa  156  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  26.71 
 
 		 611 aa  155  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  27.62 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.79 
 
 		 610 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  29.08 
 
 		 592 aa  154  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  28.06 
 
 		 619 aa  154  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 		 605 aa  154  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.68 
 
 		 610 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  26.96 
 
 		 609 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  28.64 
 
 		 596 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  27.67 
 
 		 613 aa  151  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.17 
 
 		 609 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>