More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0693 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 607 aa  1199    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  33.5 
 
 		 596 aa  326  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.5 
 
 		 592 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 592 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33 
 
 		 592 aa  316  7e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  34.25 
 
 		 613 aa  301  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  33.28 
 
 		 599 aa  300  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.99 
 
 		 592 aa  299  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  36.26 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  33 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  33 
 
 		 592 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.66 
 
 		 589 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  31.88 
 
 		 592 aa  290  4e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.49 
 
 		 593 aa  288  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.51 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.13 
 
 		 608 aa  286  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.94 
 
 		 591 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.67 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.98 
 
 		 592 aa  281  3e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  31.43 
 
 		 622 aa  278  2e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.45 
 
 		 623 aa  276  9e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.06 
 
 		 596 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.62 
 
 		 602 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.81 
 
 		 598 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.45 
 
 		 596 aa  273  9e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.89 
 
 		 596 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.54 
 
 		 588 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.33 
 
 		 589 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  30.43 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.12 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  32.69 
 
 		 619 aa  265  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.86 
 
 		 605 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.69 
 
 		 605 aa  263  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.64 
 
 		 609 aa  262  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  31.69 
 
 		 596 aa  259  8e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.73 
 
 		 597 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.58 
 
 		 616 aa  259  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.45 
 
 		 588 aa  256  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.35 
 
 		 591 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.2 
 
 		 618 aa  252  1e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 593 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.45 
 
 		 587 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  31.26 
 
 		 599 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  34.42 
 
 		 581 aa  248  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  31.79 
 
 		 627 aa  248  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.89 
 
 		 624 aa  246  6.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.05 
 
 		 601 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  27.56 
 
 		 613 aa  246  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.76 
 
 		 592 aa  243  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  33.57 
 
 		 588 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.02 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  29.61 
 
 		 632 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.57 
 
 		 609 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.07 
 
 		 605 aa  234  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.92 
 
 		 612 aa  233  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  29.76 
 
 		 609 aa  230  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  28.04 
 
 		 590 aa  229  8e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.2 
 
 		 588 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.69 
 
 		 590 aa  228  3e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.65 
 
 		 594 aa  228  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  27.11 
 
 		 609 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  27.64 
 
 		 641 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.35 
 
 		 602 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.82 
 
 		 606 aa  224  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.9 
 
 		 602 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  29.43 
 
 		 609 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.4 
 
 		 602 aa  223  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.08 
 
 		 606 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.73 
 
 		 602 aa  222  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  30.29 
 
 		 593 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  29.72 
 
 		 590 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  30.33 
 
 		 603 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.47 
 
 		 591 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  31.27 
 
 		 596 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.36 
 
 		 610 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.47 
 
 		 605 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  27.36 
 
 		 610 aa  217  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.29 
 
 		 630 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.98 
 
 		 583 aa  216  8e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  26.76 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.39 
 
 		 614 aa  213  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  29.16 
 
 		 591 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.06 
 
 		 609 aa  213  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.76 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  27.23 
 
 		 609 aa  209  9e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.02 
 
 		 609 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  27.85 
 
 		 609 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.11 
 
 		 634 aa  207  4e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  29.06 
 
 		 579 aa  207  5e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.8 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  29.51 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  28.88 
 
 		 591 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.32 
 
 		 619 aa  203  7e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  30.53 
 
 		 591 aa  203  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.93 
 
 		 588 aa  200  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.4 
 
 		 593 aa  200  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  25.59 
 
 		 611 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  26.51 
 
 		 613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  30.49 
 
 		 575 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>