More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3584 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  89.16 
 
 		 603 aa  949    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  98.85 
 
 		 609 aa  1115    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  100 
 
 		 609 aa  1131    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  55.01 
 
 		 596 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  43.38 
 
 		 581 aa  330  5.0000000000000004e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  37.32 
 
 		 592 aa  321  3e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  34.04 
 
 		 588 aa  294  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 		 588 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.86 
 
 		 596 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.65 
 
 		 612 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.47 
 
 		 596 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.3 
 
 		 597 aa  253  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.3 
 
 		 596 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.66 
 
 		 592 aa  250  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  33.07 
 
 		 609 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.55 
 
 		 602 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.55 
 
 		 596 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.48 
 
 		 599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.21 
 
 		 613 aa  234  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 		 607 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.93 
 
 		 591 aa  225  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.64 
 
 		 622 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 		 592 aa  221  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.68 
 
 		 589 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.23 
 
 		 624 aa  213  5.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  29.74 
 
 		 593 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.57 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  30.07 
 
 		 592 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  30.98 
 
 		 598 aa  207  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.91 
 
 		 613 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.89 
 
 		 619 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.94 
 
 		 614 aa  206  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  30.27 
 
 		 616 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.39 
 
 		 616 aa  205  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.08 
 
 		 610 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  28.45 
 
 		 608 aa  204  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  28.07 
 
 		 609 aa  203  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.99 
 
 		 604 aa  203  7e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.39 
 
 		 593 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.91 
 
 		 610 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  30.46 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.46 
 
 		 630 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.25 
 
 		 611 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.91 
 
 		 592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31 
 
 		 618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.97 
 
 		 588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.92 
 
 		 623 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  31.93 
 
 		 589 aa  201  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.19 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.3 
 
 		 610 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.43 
 
 		 610 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.71 
 
 		 641 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  30.59 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.29 
 
 		 591 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.08 
 
 		 610 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  27.98 
 
 		 610 aa  198  3e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.14 
 
 		 606 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  30.59 
 
 		 592 aa  198  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 605 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.07 
 
 		 592 aa  197  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  28.88 
 
 		 618 aa  197  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.66 
 
 		 608 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.66 
 
 		 608 aa  196  9e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.08 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.08 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.08 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.08 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.66 
 
 		 608 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.08 
 
 		 610 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.46 
 
 		 593 aa  194  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.5 
 
 		 608 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.5 
 
 		 608 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.36 
 
 		 611 aa  193  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  29.92 
 
 		 610 aa  193  9e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.45 
 
 		 609 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  29.92 
 
 		 610 aa  192  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  28.8 
 
 		 610 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.26 
 
 		 588 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.47 
 
 		 588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.56 
 
 		 632 aa  191  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  30.73 
 
 		 600 aa  191  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  31.07 
 
 		 588 aa  191  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.54 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.99 
 
 		 619 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.46 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  27.26 
 
 		 586 aa  188  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  26.14 
 
 		 590 aa  187  5e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  29.58 
 
 		 620 aa  187  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.79 
 
 		 594 aa  187  6e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.14 
 
 		 590 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  30.89 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.76 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.69 
 
 		 588 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  30.89 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.82 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  28.37 
 
 		 595 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  31.83 
 
 		 599 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>