More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3434 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  100 
 
 
603 aa  1128    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  87.85 
 
 
609 aa  958    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  89.16 
 
 
609 aa  983    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  55.06 
 
 
596 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  42.45 
 
 
581 aa  329  9e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  36.29 
 
 
592 aa  307  3e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.71 
 
 
588 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.22 
 
 
588 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.07 
 
 
597 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.66 
 
 
596 aa  257  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.57 
 
 
602 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.73 
 
 
596 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.73 
 
 
596 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.9 
 
 
596 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.28 
 
 
612 aa  247  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.12 
 
 
592 aa  246  9.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  33.12 
 
 
609 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.25 
 
 
599 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.49 
 
 
607 aa  232  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  30.64 
 
 
622 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  28.29 
 
 
591 aa  230  6e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 
592 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.03 
 
 
588 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  30.48 
 
 
610 aa  224  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 
613 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  31.23 
 
 
619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.61 
 
 
610 aa  220  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  30.59 
 
 
613 aa  219  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.65 
 
 
610 aa  218  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.87 
 
 
592 aa  218  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.03 
 
 
593 aa  217  5.9999999999999996e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.87 
 
 
592 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.19 
 
 
608 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  29.52 
 
 
630 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  29.52 
 
 
610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.6 
 
 
589 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 
592 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.21 
 
 
624 aa  213  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.71 
 
 
596 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.66 
 
 
610 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  29.35 
 
 
610 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.66 
 
 
610 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.66 
 
 
610 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.66 
 
 
610 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.66 
 
 
610 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.66 
 
 
610 aa  211  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.16 
 
 
593 aa  211  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.09 
 
 
611 aa  210  8e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.48 
 
 
604 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  30.78 
 
 
592 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.52 
 
 
605 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.21 
 
 
611 aa  208  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.16 
 
 
589 aa  208  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  30.78 
 
 
592 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.5 
 
 
610 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  31.09 
 
 
608 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  31.09 
 
 
608 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.5 
 
 
610 aa  207  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 
598 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  31.09 
 
 
608 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.23 
 
 
616 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.98 
 
 
608 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.98 
 
 
608 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.89 
 
 
609 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.15 
 
 
609 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.39 
 
 
623 aa  204  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.42 
 
 
588 aa  203  7e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 
588 aa  203  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.15 
 
 
609 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.2 
 
 
616 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.9 
 
 
614 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.29 
 
 
588 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.16 
 
 
608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30.88 
 
 
618 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.23 
 
 
610 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.44 
 
 
592 aa  200  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.16 
 
 
591 aa  200  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.84 
 
 
606 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.56 
 
 
609 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.56 
 
 
609 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  27.64 
 
 
609 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.53 
 
 
641 aa  197  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  31.89 
 
 
609 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.39 
 
 
619 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  30.59 
 
 
610 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  27.6 
 
 
610 aa  193  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  30.43 
 
 
610 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.76 
 
 
619 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  31.04 
 
 
599 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  30.72 
 
 
620 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.98 
 
 
613 aa  191  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.88 
 
 
593 aa  190  5e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 
588 aa  190  5e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
605 aa  189  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.63 
 
 
594 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.33 
 
 
588 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.65 
 
 
627 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.98 
 
 
590 aa  189  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  29.71 
 
 
600 aa  189  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.64 
 
 
590 aa  188  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>