280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1240 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  60.41 
 
 		 618 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  100 
 
 		 610 aa  1225    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  51.78 
 
 		 609 aa  607  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 		 619 aa  306  6e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  32.66 
 
 		 608 aa  301  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.37 
 
 		 613 aa  283  8.000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.26 
 
 		 607 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.67 
 
 		 602 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.67 
 
 		 596 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  30.96 
 
 		 596 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30.51 
 
 		 596 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.91 
 
 		 588 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.05 
 
 		 592 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.76 
 
 		 592 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.26 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.74 
 
 		 597 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.38 
 
 		 596 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.22 
 
 		 588 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  29.76 
 
 		 599 aa  244  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.6 
 
 		 592 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.91 
 
 		 589 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 		 598 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.59 
 
 		 593 aa  231  3e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.98 
 
 		 623 aa  230  5e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.52 
 
 		 592 aa  230  7e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 		 588 aa  227  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.94 
 
 		 588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.25 
 
 		 624 aa  226  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  29.96 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.78 
 
 		 622 aa  223  7e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.62 
 
 		 632 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  28.62 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.77 
 
 		 588 aa  217  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.58 
 
 		 605 aa  216  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  28.96 
 
 		 591 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  28.41 
 
 		 616 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.58 
 
 		 627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.5 
 
 		 618 aa  214  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.11 
 
 		 605 aa  213  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  28.95 
 
 		 605 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  27.98 
 
 		 592 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  26.62 
 
 		 588 aa  210  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.99 
 
 		 619 aa  210  7e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 593 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  28.88 
 
 		 609 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.55 
 
 		 592 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.55 
 
 		 592 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  28.19 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  30.58 
 
 		 591 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.02 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  25.94 
 
 		 613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.06 
 
 		 614 aa  200  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.65 
 
 		 601 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 		 591 aa  198  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  27.11 
 
 		 609 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  29.02 
 
 		 620 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  28.75 
 
 		 588 aa  196  9e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3584  TrkA-C domain protein  28.55 
 
 		 609 aa  195  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  27.61 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.17 
 
 		 605 aa  193  7e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  28.46 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  28.46 
 
 		 608 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  30.36 
 
 		 599 aa  192  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.84 
 
 		 594 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  28.79 
 
 		 596 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 		 590 aa  189  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  26.34 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  28.3 
 
 		 608 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3434  TrkA-C  28.25 
 
 		 603 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0196864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  28.3 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  28.3 
 
 		 608 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  28.49 
 
 		 587 aa  187  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  26.55 
 
 		 611 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.44 
 
 		 593 aa  187  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  29.2 
 
 		 591 aa  187  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  25.93 
 
 		 634 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26 
 
 		 610 aa  186  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  26.38 
 
 		 616 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  29.06 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3516  TrkA-C domain protein  28.41 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  30.71 
 
 		 583 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.12 
 
 		 602 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  29 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.15 
 
 		 610 aa  185  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  26.69 
 
 		 622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29 
 
 		 602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  28.04 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.47 
 
 		 602 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  28.47 
 
 		 619 aa  182  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  28.04 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  26.79 
 
 		 612 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  26.78 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  28.47 
 
 		 590 aa  180  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  27.05 
 
 		 611 aa  180  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  26.62 
 
 		 610 aa  180  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.74 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 593 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  25.5 
 
 		 609 aa  177  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  29.11 
 
 		 574 aa  177  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>