More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_00961 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  68.48 
 
 
605 aa  813    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  66.67 
 
 
601 aa  778    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  65.71 
 
 
605 aa  784    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  96.01 
 
 
602 aa  1119    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  70.35 
 
 
609 aa  827    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  98.17 
 
 
602 aa  1169    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  100 
 
 
602 aa  1187    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  89.35 
 
 
602 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  68.65 
 
 
605 aa  817    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  66.89 
 
 
606 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  39.02 
 
 
596 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  39.23 
 
 
596 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  38.85 
 
 
602 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  38.85 
 
 
596 aa  423  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  40.98 
 
 
597 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.52 
 
 
623 aa  317  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.34 
 
 
622 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.53 
 
 
588 aa  298  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.04 
 
 
592 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  34.25 
 
 
627 aa  291  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.88 
 
 
616 aa  278  2e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.68 
 
 
592 aa  271  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 
592 aa  270  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  31.61 
 
 
612 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.65 
 
 
598 aa  265  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.5 
 
 
588 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.54 
 
 
609 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 
588 aa  264  4e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.66 
 
 
591 aa  263  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.53 
 
 
589 aa  261  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.76 
 
 
588 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  33.98 
 
 
618 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.68 
 
 
593 aa  256  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  29.65 
 
 
589 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.44 
 
 
588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  34.66 
 
 
574 aa  253  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.86 
 
 
591 aa  253  8.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 
592 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 
592 aa  250  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.24 
 
 
592 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.47 
 
 
592 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.47 
 
 
592 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.3 
 
 
588 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
592 aa  246  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.97 
 
 
581 aa  245  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 
613 aa  246  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.67 
 
 
624 aa  244  1.9999999999999999e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  31.59 
 
 
579 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  29.9 
 
 
607 aa  243  5e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.54 
 
 
583 aa  243  5e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.71 
 
 
634 aa  242  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  27.66 
 
 
596 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  30.66 
 
 
590 aa  239  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  30.12 
 
 
590 aa  237  4e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.04 
 
 
596 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  32.72 
 
 
574 aa  236  6e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 
574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.48 
 
 
599 aa  234  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.09 
 
 
593 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.08 
 
 
613 aa  232  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.01 
 
 
587 aa  231  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.56 
 
 
588 aa  230  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  29.14 
 
 
593 aa  229  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.2 
 
 
609 aa  227  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  29.75 
 
 
599 aa  226  9e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.24 
 
 
609 aa  224  4e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.91 
 
 
609 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.17 
 
 
616 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.31 
 
 
609 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.74 
 
 
609 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 
574 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  29.95 
 
 
575 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.84 
 
 
619 aa  217  5.9999999999999996e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 
591 aa  216  9e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  28.86 
 
 
575 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.16 
 
 
588 aa  213  7.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 
618 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  29.45 
 
 
619 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  27.87 
 
 
605 aa  211  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.07 
 
 
630 aa  209  8e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.07 
 
 
610 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.26 
 
 
588 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.9 
 
 
610 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  28.86 
 
 
575 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  29.35 
 
 
583 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 
574 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.79 
 
 
614 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 
575 aa  205  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  27.46 
 
 
610 aa  205  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  28.69 
 
 
627 aa  204  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  28.97 
 
 
593 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.1 
 
 
593 aa  204  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  28.67 
 
 
575 aa  204  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 
593 aa  203  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.32 
 
 
588 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  30.71 
 
 
574 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  31.63 
 
 
574 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  28.31 
 
 
575 aa  200  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  31.09 
 
 
574 aa  200  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  29.52 
 
 
605 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>