More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0086 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  68.1 
 
 		 605 aa  809    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  70.46 
 
 		 609 aa  823    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  66.78 
 
 		 601 aa  780    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  66.33 
 
 		 605 aa  789    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  100 
 
 		 602 aa  1186    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  95.51 
 
 		 602 aa  1114    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  96.01 
 
 		 602 aa  1119    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  90.2 
 
 		 602 aa  1025    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  68.26 
 
 		 605 aa  813    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  66.72 
 
 		 606 aa  754    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  38.75 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  39.12 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  38.95 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  39.12 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  40.98 
 
 		 597 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  35.82 
 
 		 623 aa  323  6e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.95 
 
 		 622 aa  320  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  35.41 
 
 		 627 aa  299  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.14 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.64 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.62 
 
 		 616 aa  274  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  30.55 
 
 		 592 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  29.98 
 
 		 592 aa  270  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  32.11 
 
 		 612 aa  270  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  31.99 
 
 		 609 aa  268  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.55 
 
 		 588 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  35.08 
 
 		 618 aa  260  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  30.86 
 
 		 589 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.19 
 
 		 593 aa  259  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.98 
 
 		 588 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.59 
 
 		 591 aa  257  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  30.87 
 
 		 588 aa  256  6e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.17 
 
 		 588 aa  256  9e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.26 
 
 		 588 aa  254  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  34.3 
 
 		 574 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.66 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 		 592 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 		 592 aa  249  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.29 
 
 		 634 aa  248  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  27.06 
 
 		 592 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  29.97 
 
 		 591 aa  248  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  29.06 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  27.06 
 
 		 592 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  28.64 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.81 
 
 		 613 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  28.64 
 
 		 592 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 		 607 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  29.93 
 
 		 593 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.38 
 
 		 596 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.69 
 
 		 624 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  31.6 
 
 		 579 aa  242  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.54 
 
 		 574 aa  240  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  27.69 
 
 		 596 aa  240  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.64 
 
 		 613 aa  237  6e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  30.84 
 
 		 590 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.12 
 
 		 599 aa  236  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.22 
 
 		 583 aa  236  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  29.77 
 
 		 590 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.32 
 
 		 609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  32.49 
 
 		 574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  31.35 
 
 		 587 aa  232  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  29.12 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.24 
 
 		 609 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  27.82 
 
 		 593 aa  224  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.08 
 
 		 609 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.98 
 
 		 609 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 574 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  29.85 
 
 		 599 aa  223  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.61 
 
 		 619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.57 
 
 		 616 aa  220  6e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  29.58 
 
 		 591 aa  220  6e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.23 
 
 		 588 aa  220  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  30.12 
 
 		 575 aa  217  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  29.18 
 
 		 575 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 		 619 aa  216  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  27.8 
 
 		 610 aa  211  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.9 
 
 		 630 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.9 
 
 		 610 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  29.55 
 
 		 583 aa  211  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.6 
 
 		 588 aa  210  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.73 
 
 		 610 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  31.67 
 
 		 574 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.8 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.08 
 
 		 593 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  29.34 
 
 		 575 aa  209  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  32.93 
 
 		 574 aa  207  4e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  28.87 
 
 		 596 aa  206  9e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  33.05 
 
 		 574 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 		 575 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  30.11 
 
 		 614 aa  205  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.52 
 
 		 594 aa  205  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.85 
 
 		 610 aa  205  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  28.99 
 
 		 593 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 		 574 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  31.09 
 
 		 574 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.06 
 
 		 605 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 574 aa  203  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 		 591 aa  203  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  31.48 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>