More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_00931 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  68.52 
 
 
605 aa  802    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  67.51 
 
 
601 aa  779    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  68.29 
 
 
605 aa  792    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  90.2 
 
 
602 aa  1065    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  70.97 
 
 
609 aa  814    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  89.35 
 
 
602 aa  1050    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  100 
 
 
602 aa  1177    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  68.27 
 
 
605 aa  807    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  69.04 
 
 
606 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  88.69 
 
 
602 aa  1046    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  40.07 
 
 
596 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  39.86 
 
 
596 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  38.95 
 
 
596 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  38.79 
 
 
602 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  40.32 
 
 
597 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  35.53 
 
 
623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  33.01 
 
 
622 aa  321  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  34.37 
 
 
627 aa  296  5e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.99 
 
 
592 aa  293  7e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.24 
 
 
588 aa  283  7.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.83 
 
 
616 aa  279  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  31.07 
 
 
592 aa  278  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  34.38 
 
 
612 aa  278  2e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  34.62 
 
 
609 aa  277  4e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  31 
 
 
592 aa  276  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  33.95 
 
 
598 aa  272  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.41 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.79 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.31 
 
 
588 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.25 
 
 
589 aa  264  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.9 
 
 
593 aa  263  4.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.55 
 
 
618 aa  260  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  31.29 
 
 
591 aa  259  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.02 
 
 
592 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  29.12 
 
 
592 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  32.72 
 
 
591 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.51 
 
 
588 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  31.2 
 
 
588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.11 
 
 
592 aa  252  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.11 
 
 
592 aa  253  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  29.35 
 
 
592 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.33 
 
 
581 aa  251  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  29.35 
 
 
592 aa  251  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.98 
 
 
607 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  33.45 
 
 
574 aa  248  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  30.42 
 
 
589 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
613 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.92 
 
 
596 aa  244  5e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.89 
 
 
613 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  29.73 
 
 
593 aa  242  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.05 
 
 
574 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.79 
 
 
599 aa  241  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.46 
 
 
634 aa  240  5.999999999999999e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  32.02 
 
 
579 aa  239  9e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.54 
 
 
609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.69 
 
 
624 aa  234  3e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  32.36 
 
 
587 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  29.89 
 
 
590 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  29.29 
 
 
593 aa  234  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.17 
 
 
583 aa  233  9e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  27.44 
 
 
596 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  31.66 
 
 
574 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  29.72 
 
 
590 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.31 
 
 
609 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  31.21 
 
 
599 aa  228  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  29.54 
 
 
609 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.25 
 
 
588 aa  223  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.87 
 
 
619 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 
591 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  29.37 
 
 
609 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  29.86 
 
 
609 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  31.95 
 
 
575 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.28 
 
 
619 aa  220  5e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.84 
 
 
616 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  30.52 
 
 
574 aa  219  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.16 
 
 
588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.52 
 
 
588 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  29.01 
 
 
575 aa  211  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  31.65 
 
 
583 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  31.35 
 
 
574 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.87 
 
 
593 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.07 
 
 
593 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  28.21 
 
 
605 aa  210  6e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.85 
 
 
588 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  29.83 
 
 
575 aa  210  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  29.35 
 
 
596 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  29.69 
 
 
575 aa  209  1e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  27.9 
 
 
610 aa  207  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  30.57 
 
 
574 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.35 
 
 
610 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  29.06 
 
 
594 aa  207  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.21 
 
 
591 aa  207  4e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  30.96 
 
 
574 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  29.04 
 
 
627 aa  206  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  30.75 
 
 
575 aa  206  8e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.73 
 
 
630 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.73 
 
 
610 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  30.96 
 
 
574 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  30.96 
 
 
574 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.76 
 
 
614 aa  203  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>