More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_02561 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  76.07 
 
 
605 aa  878    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  75.83 
 
 
601 aa  865    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  76.4 
 
 
605 aa  888    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  66.72 
 
 
602 aa  793    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  77.63 
 
 
609 aa  894    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  66.89 
 
 
602 aa  795    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  70.07 
 
 
602 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  76.24 
 
 
605 aa  880    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  100 
 
 
606 aa  1176    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  66.39 
 
 
602 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  40.1 
 
 
602 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  40.27 
 
 
596 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  39.23 
 
 
596 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  39.39 
 
 
596 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  40.67 
 
 
597 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.46 
 
 
622 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.85 
 
 
623 aa  321  3e-86  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  35.18 
 
 
627 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.05 
 
 
588 aa  299  1e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.4 
 
 
591 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.99 
 
 
592 aa  283  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.59 
 
 
588 aa  278  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35 
 
 
612 aa  276  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.61 
 
 
592 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.25 
 
 
592 aa  273  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.85 
 
 
588 aa  273  9e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  33.94 
 
 
609 aa  272  1e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.5 
 
 
616 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  31.25 
 
 
592 aa  270  8e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.44 
 
 
588 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.79 
 
 
589 aa  269  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.37 
 
 
592 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.37 
 
 
592 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.44 
 
 
588 aa  266  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.99 
 
 
593 aa  265  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.08 
 
 
592 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.08 
 
 
592 aa  262  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 
598 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  31.97 
 
 
613 aa  259  1e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.45 
 
 
613 aa  256  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.7 
 
 
593 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.52 
 
 
592 aa  254  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.98 
 
 
596 aa  252  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.82 
 
 
588 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  31.19 
 
 
589 aa  250  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.24 
 
 
618 aa  249  8e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  33.67 
 
 
591 aa  249  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 
607 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.73 
 
 
587 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  31.73 
 
 
574 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  28.72 
 
 
599 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  33.28 
 
 
581 aa  237  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.23 
 
 
616 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.27 
 
 
609 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  30.95 
 
 
574 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.81 
 
 
583 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  31.17 
 
 
609 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  26.92 
 
 
590 aa  233  9e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.15 
 
 
624 aa  232  1e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  30.88 
 
 
574 aa  232  1e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.97 
 
 
609 aa  232  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  27.1 
 
 
590 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.8 
 
 
619 aa  230  7e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.69 
 
 
596 aa  227  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  30.07 
 
 
593 aa  227  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  33.47 
 
 
579 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  30.63 
 
 
609 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  33.22 
 
 
599 aa  227  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  31.45 
 
 
575 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  30.84 
 
 
609 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 
588 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  30.16 
 
 
591 aa  224  3e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.85 
 
 
593 aa  222  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  27.72 
 
 
591 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.08 
 
 
619 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  31.51 
 
 
574 aa  221  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.63 
 
 
588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  30.03 
 
 
587 aa  221  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  29.04 
 
 
608 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  32.53 
 
 
574 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  28.22 
 
 
611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  28.52 
 
 
634 aa  217  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.49 
 
 
605 aa  216  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.95 
 
 
593 aa  216  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.18 
 
 
588 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 
618 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  30.54 
 
 
627 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  30.88 
 
 
574 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  27.99 
 
 
630 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  29.7 
 
 
608 aa  211  4e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  29.51 
 
 
575 aa  210  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.65 
 
 
606 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  32.02 
 
 
574 aa  210  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
574 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.9 
 
 
610 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
574 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  27.89 
 
 
610 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  27.89 
 
 
610 aa  207  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  30.14 
 
 
575 aa  208  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  31.08 
 
 
583 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>