More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2889 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  100 
 
 		 583 aa  1157    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  55.34 
 
 		 575 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  53.38 
 
 		 574 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  54.77 
 
 		 574 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  50 
 
 		 574 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  50.18 
 
 		 574 aa  513  1e-144  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  47.76 
 
 		 574 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  49.22 
 
 		 574 aa  504  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  49.22 
 
 		 574 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  50.09 
 
 		 574 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  49.91 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  49.22 
 
 		 574 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  49.74 
 
 		 574 aa  475  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  49.05 
 
 		 574 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  48.88 
 
 		 574 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  45.28 
 
 		 579 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  41.81 
 
 		 575 aa  405  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  41.61 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  41.54 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  41.2 
 
 		 575 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  39.86 
 
 		 575 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  40.62 
 
 		 575 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  40.34 
 
 		 575 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  39.24 
 
 		 574 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  41.68 
 
 		 578 aa  340  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  34.51 
 
 		 591 aa  320  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  35.6 
 
 		 589 aa  300  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.91 
 
 		 588 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  33.84 
 
 		 588 aa  293  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  34.78 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.72 
 
 		 588 aa  280  4e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.89 
 
 		 592 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  35.14 
 
 		 589 aa  274  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  34.48 
 
 		 588 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  34.04 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.66 
 
 		 587 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  35.53 
 
 		 591 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  34.8 
 
 		 575 aa  255  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.31 
 
 		 588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  32.27 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  32.67 
 
 		 598 aa  233  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.3 
 
 		 583 aa  233  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.6 
 
 		 597 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.17 
 
 		 622 aa  222  9.999999999999999e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.4 
 
 		 592 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.4 
 
 		 592 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.4 
 
 		 592 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.55 
 
 		 601 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.19 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.88 
 
 		 596 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.71 
 
 		 596 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29 
 
 		 596 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.83 
 
 		 602 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  30.76 
 
 		 634 aa  212  1e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  28.29 
 
 		 624 aa  205  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  31.5 
 
 		 572 aa  204  4e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  33.6 
 
 		 592 aa  204  5e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  28.66 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  27.44 
 
 		 613 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.71 
 
 		 609 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.82 
 
 		 602 aa  200  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.4 
 
 		 607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.64 
 
 		 602 aa  197  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  29.85 
 
 		 588 aa  197  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.39 
 
 		 599 aa  197  6e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.69 
 
 		 623 aa  195  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.97 
 
 		 593 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.68 
 
 		 592 aa  195  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.69 
 
 		 581 aa  194  5e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.46 
 
 		 602 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.19 
 
 		 605 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.35 
 
 		 622 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.19 
 
 		 605 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.6 
 
 		 602 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  28.71 
 
 		 616 aa  188  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.64 
 
 		 606 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 		 592 aa  188  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 		 618 aa  187  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  29.89 
 
 		 610 aa  187  4e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  32.33 
 
 		 599 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.66 
 
 		 609 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.87 
 
 		 604 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.68 
 
 		 618 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.38 
 
 		 619 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  27.3 
 
 		 609 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  27.38 
 
 		 613 aa  177  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.28 
 
 		 627 aa  176  8e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  27.3 
 
 		 612 aa  173  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.79 
 
 		 596 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.51 
 
 		 616 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  28.7 
 
 		 588 aa  171  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 		 619 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  26.69 
 
 		 610 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  26.69 
 
 		 630 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  26.66 
 
 		 606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  26.69 
 
 		 610 aa  167  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  26.84 
 
 		 611 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  26.59 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.83 
 
 		 609 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  26.29 
 
 		 621 aa  164  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>