298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00768 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  77.31 
 
 		 575 aa  877    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1144    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  94.25 
 
 		 574 aa  1068    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  54.77 
 
 		 583 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  53.79 
 
 		 574 aa  588  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  52.7 
 
 		 574 aa  591  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  53.72 
 
 		 574 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  51.65 
 
 		 574 aa  561  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  52.65 
 
 		 574 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  53.71 
 
 		 574 aa  537  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  52.47 
 
 		 574 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  53.71 
 
 		 574 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  52.65 
 
 		 574 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  53 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  52.65 
 
 		 574 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  43.55 
 
 		 579 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  42.36 
 
 		 575 aa  419  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  43.66 
 
 		 575 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  42.78 
 
 		 575 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  44.77 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  41.73 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  42.96 
 
 		 575 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  41.29 
 
 		 575 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  43.16 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  44.38 
 
 		 578 aa  376  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  35.15 
 
 		 591 aa  325  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.47 
 
 		 588 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.05 
 
 		 589 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  35.54 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.94 
 
 		 588 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  35.54 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.02 
 
 		 591 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  32.66 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.71 
 
 		 589 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  32.33 
 
 		 593 aa  282  9e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  31.59 
 
 		 592 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.16 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 598 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  32.04 
 
 		 575 aa  245  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  32.11 
 
 		 583 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  31.71 
 
 		 622 aa  242  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.77 
 
 		 596 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  30.59 
 
 		 605 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  30.26 
 
 		 601 aa  231  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.23 
 
 		 634 aa  227  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.7 
 
 		 624 aa  227  5.0000000000000005e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.04 
 
 		 588 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  31.61 
 
 		 572 aa  224  4.9999999999999996e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  32.55 
 
 		 592 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.39 
 
 		 592 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.66 
 
 		 597 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.19 
 
 		 593 aa  216  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.42 
 
 		 592 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.6 
 
 		 623 aa  210  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  26.99 
 
 		 596 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 608 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.07 
 
 		 602 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.64 
 
 		 605 aa  204  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  29.53 
 
 		 599 aa  203  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.39 
 
 		 605 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  32.16 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 		 592 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.37 
 
 		 622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  27.62 
 
 		 596 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  30.15 
 
 		 581 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.18 
 
 		 606 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  29.13 
 
 		 609 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.45 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.37 
 
 		 627 aa  193  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  30 
 
 		 618 aa  193  8e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.77 
 
 		 607 aa  189  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.35 
 
 		 602 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  30.33 
 
 		 602 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  27.12 
 
 		 588 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  28.38 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.41 
 
 		 602 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  29.17 
 
 		 609 aa  178  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 		 613 aa  177  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.77 
 
 		 602 aa  177  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  26.55 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  27.68 
 
 		 616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  28.65 
 
 		 596 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  26.92 
 
 		 612 aa  174  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  24.75 
 
 		 613 aa  171  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  25.42 
 
 		 616 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  25.42 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  27.18 
 
 		 604 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  29.95 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  28.32 
 
 		 596 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.48 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  29.35 
 
 		 609 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  27.4 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  27.4 
 
 		 592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.12 
 
 		 618 aa  163  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  26.84 
 
 		 610 aa  160  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  25.51 
 
 		 610 aa  160  6e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  27.72 
 
 		 610 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  25.77 
 
 		 610 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  25.77 
 
 		 630 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  27.31 
 
 		 611 aa  157  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>