More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_14922 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  100 
 
 
572 aa  1139    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  85.54 
 
 
622 aa  980    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  55.98 
 
 
583 aa  611  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  51.82 
 
 
634 aa  554  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  42.28 
 
 
589 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  40.04 
 
 
589 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  39.66 
 
 
588 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  38.23 
 
 
588 aa  365  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  40.25 
 
 
587 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  37.24 
 
 
588 aa  362  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  38 
 
 
588 aa  359  8e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  41.45 
 
 
588 aa  358  1.9999999999999998e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  36.7 
 
 
591 aa  340  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  38.89 
 
 
591 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  36.12 
 
 
592 aa  296  7e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  35.86 
 
 
593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.92 
 
 
588 aa  252  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  30.12 
 
 
596 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.05 
 
 
602 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  31.82 
 
 
597 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.04 
 
 
622 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.6 
 
 
624 aa  236  7e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.67 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.85 
 
 
596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  31.86 
 
 
574 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  32.57 
 
 
574 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  33.08 
 
 
575 aa  231  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  31.91 
 
 
574 aa  229  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  31.95 
 
 
574 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 
598 aa  224  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.6 
 
 
588 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.17 
 
 
581 aa  220  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  33.1 
 
 
574 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.92 
 
 
596 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  31.98 
 
 
579 aa  217  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  32.24 
 
 
574 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.66 
 
 
605 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.66 
 
 
605 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.49 
 
 
623 aa  212  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  31.95 
 
 
575 aa  210  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.05 
 
 
616 aa  210  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  32.14 
 
 
574 aa  210  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  33 
 
 
583 aa  209  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  34 
 
 
578 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.71 
 
 
608 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  29.88 
 
 
605 aa  207  5e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.76 
 
 
592 aa  206  7e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  30.43 
 
 
607 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 
575 aa  205  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.32 
 
 
613 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.78 
 
 
610 aa  203  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.35 
 
 
618 aa  202  9e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  31.94 
 
 
575 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  30.84 
 
 
627 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.28 
 
 
592 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 
575 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  31.35 
 
 
575 aa  201  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  32.36 
 
 
574 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  29.6 
 
 
599 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.05 
 
 
592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.24 
 
 
609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  29.3 
 
 
605 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  28.52 
 
 
593 aa  198  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 
592 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  29.33 
 
 
596 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 
619 aa  198  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  29.78 
 
 
611 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30 
 
 
619 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.17 
 
 
612 aa  196  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  32.36 
 
 
574 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  29.29 
 
 
592 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.26 
 
 
610 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.66 
 
 
611 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.26 
 
 
610 aa  195  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  32.36 
 
 
574 aa  195  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.26 
 
 
630 aa  195  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  32.53 
 
 
574 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  29.11 
 
 
592 aa  194  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  27.86 
 
 
588 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  28.25 
 
 
609 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.31 
 
 
613 aa  193  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.32 
 
 
593 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  32.4 
 
 
574 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 
574 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  29.93 
 
 
601 aa  191  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.41 
 
 
619 aa  190  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  31.95 
 
 
574 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  28.7 
 
 
602 aa  186  9e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  28.89 
 
 
602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  26.34 
 
 
610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.66 
 
 
610 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  30.88 
 
 
575 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  28.25 
 
 
602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  28.28 
 
 
632 aa  182  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  27.99 
 
 
592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  27.99 
 
 
602 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  27.99 
 
 
592 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.9 
 
 
606 aa  181  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  28.09 
 
 
616 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  30.48 
 
 
575 aa  180  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>