230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2448 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
575 aa  1117    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  37.48 
 
 
579 aa  323  4e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  36.71 
 
 
575 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  36.07 
 
 
575 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  38.05 
 
 
575 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  33.85 
 
 
575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  37.33 
 
 
583 aa  265  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  35.24 
 
 
575 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  38.27 
 
 
578 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  35.12 
 
 
574 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.92 
 
 
574 aa  257  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  33.57 
 
 
574 aa  257  5e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  35.55 
 
 
575 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  34.09 
 
 
575 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.52 
 
 
575 aa  247  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.08 
 
 
574 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  33.33 
 
 
574 aa  244  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  34.11 
 
 
574 aa  240  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  32.52 
 
 
574 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 
574 aa  233  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  33.21 
 
 
588 aa  231  3e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.59 
 
 
591 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 
574 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  35.61 
 
 
574 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  35.04 
 
 
574 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  33.33 
 
 
588 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  35.81 
 
 
574 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  34.97 
 
 
574 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  35.17 
 
 
574 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  32.04 
 
 
591 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  31.64 
 
 
589 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  32.59 
 
 
588 aa  220  6e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  33.2 
 
 
592 aa  217  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  33.52 
 
 
588 aa  216  8e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  31.91 
 
 
589 aa  207  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.96 
 
 
609 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 
588 aa  198  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
592 aa  196  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  30 
 
 
593 aa  195  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  29.03 
 
 
583 aa  195  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.99 
 
 
605 aa  192  1e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.89 
 
 
587 aa  192  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.66 
 
 
605 aa  190  5e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  30.66 
 
 
605 aa  190  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  31.38 
 
 
602 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  31.63 
 
 
601 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  31.15 
 
 
602 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.13 
 
 
602 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  31.15 
 
 
602 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.92 
 
 
596 aa  186  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  28.88 
 
 
597 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.03 
 
 
596 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.98 
 
 
596 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.62 
 
 
602 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  28.46 
 
 
592 aa  177  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  28.46 
 
 
592 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  30.76 
 
 
606 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  29.49 
 
 
588 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  27.26 
 
 
592 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  28.89 
 
 
593 aa  172  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.83 
 
 
627 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  27.72 
 
 
590 aa  168  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  27.45 
 
 
619 aa  167  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.8 
 
 
622 aa  167  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  28.36 
 
 
592 aa  167  5e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  27.94 
 
 
622 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  31.38 
 
 
609 aa  165  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  28.94 
 
 
623 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  30.65 
 
 
572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  29.81 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  28.24 
 
 
590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.55 
 
 
588 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.07 
 
 
588 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  27.94 
 
 
588 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  28.52 
 
 
591 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  26.6 
 
 
596 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  26.41 
 
 
605 aa  157  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  27.94 
 
 
588 aa  154  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.66 
 
 
618 aa  154  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  27.62 
 
 
610 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  29.32 
 
 
598 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  28.98 
 
 
591 aa  149  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  26.35 
 
 
593 aa  146  9e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  28.65 
 
 
586 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  27.24 
 
 
594 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  26.65 
 
 
593 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  27.42 
 
 
599 aa  144  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  24.56 
 
 
590 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  27.58 
 
 
592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  23.84 
 
 
590 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  25.79 
 
 
634 aa  141  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  26.22 
 
 
593 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.62 
 
 
599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  28.03 
 
 
587 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  25.37 
 
 
613 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  27.37 
 
 
616 aa  139  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  25.84 
 
 
592 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  25.54 
 
 
624 aa  139  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  25.84 
 
 
592 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  28.49 
 
 
619 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>