296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3185 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  79.97 
 
 		 574 aa  864    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  76.48 
 
 		 574 aa  874    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  83.45 
 
 		 574 aa  956    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  79.97 
 
 		 574 aa  850    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  80.84 
 
 		 574 aa  840    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  80.14 
 
 		 574 aa  832    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 574 aa  1125    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  79.79 
 
 		 574 aa  861    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  79.97 
 
 		 574 aa  836    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  78.75 
 
 		 574 aa  880    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  80.14 
 
 		 574 aa  852    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  52.7 
 
 		 574 aa  583  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  53.42 
 
 		 575 aa  576  1.0000000000000001e-163  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  52.7 
 
 		 574 aa  557  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  48.7 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  47.29 
 
 		 575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  44.62 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  45.58 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  46.29 
 
 		 575 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  47.54 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  45.78 
 
 		 575 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  44.41 
 
 		 575 aa  410  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  46.41 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  43.36 
 
 		 575 aa  374  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  42.1 
 
 		 574 aa  352  8e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  36.95 
 
 		 591 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  37.39 
 
 		 588 aa  313  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  37.04 
 
 		 588 aa  309  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  35.42 
 
 		 588 aa  300  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.8 
 
 		 589 aa  299  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.86 
 
 		 589 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  34.57 
 
 		 592 aa  286  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  35.11 
 
 		 593 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  35.87 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  34.85 
 
 		 591 aa  281  2e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  36.65 
 
 		 588 aa  278  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  34.24 
 
 		 587 aa  262  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  33.27 
 
 		 583 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  32.54 
 
 		 605 aa  260  6e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.21 
 
 		 601 aa  255  1.0000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  34.74 
 
 		 598 aa  247  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  31.44 
 
 		 588 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2448  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 		 575 aa  242  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  31.63 
 
 		 605 aa  238  3e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  31.63 
 
 		 605 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  31.35 
 
 		 596 aa  236  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  31.05 
 
 		 634 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  30.51 
 
 		 588 aa  231  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  30.94 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  33.39 
 
 		 602 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  30.2 
 
 		 597 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.85 
 
 		 602 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  30.73 
 
 		 624 aa  223  4.9999999999999996e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.2 
 
 		 592 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.2 
 
 		 592 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  32.49 
 
 		 602 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.58 
 
 		 606 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.09 
 
 		 593 aa  218  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  33.76 
 
 		 622 aa  217  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.9 
 
 		 592 aa  217  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  32.04 
 
 		 588 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  28.42 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.96 
 
 		 602 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  30.11 
 
 		 592 aa  213  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  29.08 
 
 		 596 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.9 
 
 		 596 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.78 
 
 		 596 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.72 
 
 		 602 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.58 
 
 		 632 aa  211  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  30.09 
 
 		 608 aa  210  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  30.83 
 
 		 609 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.03 
 
 		 623 aa  206  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.15 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.07 
 
 		 599 aa  203  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.38 
 
 		 592 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  28.47 
 
 		 613 aa  200  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  32.44 
 
 		 572 aa  199  7.999999999999999e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.31 
 
 		 612 aa  199  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.65 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  31.22 
 
 		 592 aa  197  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  28.55 
 
 		 607 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  28.31 
 
 		 621 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  28.65 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  28.52 
 
 		 627 aa  190  7e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  31.02 
 
 		 619 aa  189  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  28.67 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.04 
 
 		 616 aa  187  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  26.31 
 
 		 619 aa  187  5e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  28.8 
 
 		 614 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  26.16 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.16 
 
 		 590 aa  186  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  29.21 
 
 		 590 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  29.61 
 
 		 619 aa  183  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  30.7 
 
 		 596 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  28.65 
 
 		 609 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  30.75 
 
 		 609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  29.04 
 
 		 618 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  26.61 
 
 		 588 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.38 
 
 		 616 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  28.92 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>