More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2351 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  57.22 
 
 		 589 aa  680    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  69.56 
 
 		 588 aa  779    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  100 
 
 		 588 aa  1156    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  54.76 
 
 		 588 aa  607  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  51.78 
 
 		 589 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  51.7 
 
 		 588 aa  593  1e-168  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  52.56 
 
 		 587 aa  531  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  47.62 
 
 		 588 aa  531  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  44.87 
 
 		 591 aa  487  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_1343  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  43.08 
 
 		 583 aa  428  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.351628  normal  0.572139 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39202  DASS family transporter: sodium ion/sulfate  42.61 
 
 		 634 aa  424  1e-117  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21287 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  43.92 
 
 		 592 aa  420  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  44.41 
 
 		 591 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22453  predicted protein  40.61 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14922  predicted protein  40.73 
 
 		 572 aa  354  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1749  TrkA-C domain protein  34.55 
 
 		 593 aa  331  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.0276756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  36.23 
 
 		 598 aa  330  6e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 		 575 aa  329  8e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 		 575 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  35.23 
 
 		 575 aa  323  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  34.62 
 
 		 574 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  35.86 
 
 		 579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  34.78 
 
 		 596 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 575 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  33 
 
 		 602 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  33 
 
 		 596 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  36.59 
 
 		 574 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  34.07 
 
 		 575 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.39 
 
 		 588 aa  302  9e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  35.41 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  34.78 
 
 		 583 aa  300  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  34.86 
 
 		 574 aa  300  4e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  34.9 
 
 		 622 aa  296  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  32.75 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  35.2 
 
 		 608 aa  294  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  33.89 
 
 		 588 aa  293  5e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.5 
 
 		 596 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  34.01 
 
 		 575 aa  292  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  34.35 
 
 		 592 aa  292  1e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  31.67 
 
 		 596 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  36.2 
 
 		 574 aa  291  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  34.56 
 
 		 623 aa  289  1e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  34.46 
 
 		 574 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  33.16 
 
 		 592 aa  286  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  36.15 
 
 		 581 aa  283  8.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  33.33 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  34.52 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  33.39 
 
 		 605 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  33.22 
 
 		 575 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  33.28 
 
 		 575 aa  280  7e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  33.1 
 
 		 592 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  33.1 
 
 		 605 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  33.1 
 
 		 605 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  29.74 
 
 		 624 aa  273  6e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  32.71 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.51 
 
 		 627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  33.22 
 
 		 593 aa  271  2.9999999999999997e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  34.69 
 
 		 574 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 		 592 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  32.43 
 
 		 592 aa  270  5e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  34.42 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  35.15 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  35.2 
 
 		 574 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  34.91 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  33.57 
 
 		 607 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  40.45 
 
 		 578 aa  263  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  35.32 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  34.72 
 
 		 599 aa  262  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.44 
 
 		 606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.3 
 
 		 616 aa  260  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  31.1 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  31.32 
 
 		 613 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  31.48 
 
 		 602 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  31.31 
 
 		 602 aa  254  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.09 
 
 		 592 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  34.32 
 
 		 605 aa  252  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  32.35 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.77 
 
 		 593 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  32.69 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  32.19 
 
 		 592 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  32.19 
 
 		 592 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  30.87 
 
 		 602 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  33.09 
 
 		 613 aa  243  5e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  31.97 
 
 		 594 aa  240  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.64 
 
 		 618 aa  238  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  30.36 
 
 		 612 aa  236  8e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  31.42 
 
 		 602 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.96 
 
 		 588 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  30.53 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  31.1 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.79 
 
 		 609 aa  226  8e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  28.62 
 
 		 630 aa  226  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  28.62 
 
 		 610 aa  226  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  31.62 
 
 		 618 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  28.62 
 
 		 610 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  30.66 
 
 		 593 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.9 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  29.83 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  28.93 
 
 		 610 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>