More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0490 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  100 
 
 		 605 aa  1163    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  53.38 
 
 		 604 aa  566  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  47.8 
 
 		 600 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  54.65 
 
 		 600 aa  494  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  47.55 
 
 		 612 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.84 
 
 		 612 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  36.51 
 
 		 609 aa  325  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  32.84 
 
 		 613 aa  300  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  33.06 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  33.55 
 
 		 609 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  33.11 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  34.48 
 
 		 610 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  31.13 
 
 		 610 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.96 
 
 		 630 aa  280  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.96 
 
 		 610 aa  279  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.97 
 
 		 610 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  50.17 
 
 		 512 aa  278  3e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  34.15 
 
 		 610 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  32.26 
 
 		 610 aa  276  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  33.28 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  33.11 
 
 		 609 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  33 
 
 		 610 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  31.43 
 
 		 609 aa  270  4e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  31.72 
 
 		 610 aa  266  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  32.42 
 
 		 610 aa  266  8.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  32.26 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  32.26 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  32.26 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  32.26 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  32.26 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  32.26 
 
 		 610 aa  266  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  31.62 
 
 		 619 aa  264  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  33.06 
 
 		 627 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  32.1 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  31.13 
 
 		 616 aa  261  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  29.9 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.68 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.68 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  34.3 
 
 		 609 aa  256  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.68 
 
 		 608 aa  256  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.68 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.68 
 
 		 608 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.74 
 
 		 620 aa  254  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  30.46 
 
 		 611 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  28.18 
 
 		 619 aa  244  5e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.08 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  30.86 
 
 		 609 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.91 
 
 		 588 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  30.18 
 
 		 593 aa  229  2e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  32.15 
 
 		 545 aa  225  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  31.18 
 
 		 604 aa  224  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  30.4 
 
 		 592 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  33.01 
 
 		 593 aa  221  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  31.54 
 
 		 632 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.17 
 
 		 605 aa  219  1e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  30.64 
 
 		 613 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  27.12 
 
 		 596 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  30.08 
 
 		 616 aa  214  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.14 
 
 		 602 aa  213  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.02 
 
 		 608 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 591 aa  213  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  28.5 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.27 
 
 		 618 aa  211  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.13 
 
 		 581 aa  209  9e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.46 
 
 		 597 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  29.28 
 
 		 602 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  29.69 
 
 		 602 aa  208  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  33.55 
 
 		 593 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  31.52 
 
 		 614 aa  206  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.26 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  27.37 
 
 		 622 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  29.35 
 
 		 602 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  26.76 
 
 		 607 aa  201  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.3 
 
 		 589 aa  200  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  30.65 
 
 		 588 aa  200  7e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.47 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  31 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  25.6 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  28.78 
 
 		 588 aa  196  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.46 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  28.07 
 
 		 590 aa  195  2e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  28.71 
 
 		 598 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  28.57 
 
 		 595 aa  195  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  26.91 
 
 		 590 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  29.28 
 
 		 596 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  25.6 
 
 		 596 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  27.08 
 
 		 590 aa  194  4e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  29.08 
 
 		 605 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  29.48 
 
 		 591 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  29.08 
 
 		 605 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  30.07 
 
 		 591 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  29.14 
 
 		 605 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  28.85 
 
 		 591 aa  191  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.13 
 
 		 606 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  29.34 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.68 
 
 		 593 aa  188  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  27.4 
 
 		 623 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.34 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00931  DASS family sodium/sulfate transporter  29.67 
 
 		 602 aa  186  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.490599  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  28.96 
 
 		 601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>