More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0107 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  100 
 
 		 545 aa  1053    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  48.24 
 
 		 612 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  47.32 
 
 		 609 aa  405  1e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  41.32 
 
 		 613 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  36.58 
 
 		 611 aa  329  7e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  38.53 
 
 		 609 aa  327  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  36.72 
 
 		 610 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  36.53 
 
 		 619 aa  321  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  38.21 
 
 		 609 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  36.7 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  36.7 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  38.39 
 
 		 609 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  36.7 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  36.7 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  36.7 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  36.7 
 
 		 610 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  38.21 
 
 		 609 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  36.7 
 
 		 610 aa  317  5e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  36.35 
 
 		 630 aa  316  5e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  36.28 
 
 		 610 aa  316  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  35.64 
 
 		 610 aa  315  9.999999999999999e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  36.03 
 
 		 619 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  36.28 
 
 		 610 aa  315  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  36.51 
 
 		 610 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  36.15 
 
 		 608 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  36.15 
 
 		 608 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  36.15 
 
 		 608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  36.75 
 
 		 611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  36.15 
 
 		 608 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  36.33 
 
 		 610 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  37.29 
 
 		 616 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  36.15 
 
 		 608 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  36.5 
 
 		 621 aa  311  2.9999999999999997e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  38.98 
 
 		 610 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  36.47 
 
 		 610 aa  307  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  38.8 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  37.23 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  32.96 
 
 		 588 aa  276  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  35.68 
 
 		 620 aa  269  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  36.2 
 
 		 609 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  35.53 
 
 		 609 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  34.34 
 
 		 627 aa  250  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  33.76 
 
 		 600 aa  242  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.64 
 
 		 597 aa  233  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  32.22 
 
 		 589 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.9 
 
 		 622 aa  226  9e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.55 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  33.64 
 
 		 604 aa  221  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  32.9 
 
 		 592 aa  219  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  31.43 
 
 		 605 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  28.94 
 
 		 596 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  28.76 
 
 		 602 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  33.45 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  31.05 
 
 		 608 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.63 
 
 		 588 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  31.48 
 
 		 623 aa  213  7e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 605 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.47 
 
 		 593 aa  210  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  30 
 
 		 596 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.98 
 
 		 606 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  32.15 
 
 		 605 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  29.81 
 
 		 596 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  29.97 
 
 		 627 aa  204  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.84 
 
 		 616 aa  203  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  31.21 
 
 		 618 aa  200  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.73 
 
 		 588 aa  193  7e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  31.95 
 
 		 581 aa  193  8e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  31.95 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  27.27 
 
 		 613 aa  190  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.3 
 
 		 588 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  31.47 
 
 		 612 aa  189  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  31.55 
 
 		 595 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  29.94 
 
 		 588 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.13 
 
 		 594 aa  179  9e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  28.68 
 
 		 592 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.83 
 
 		 588 aa  176  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  30.4 
 
 		 593 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.25 
 
 		 596 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  32.89 
 
 		 600 aa  174  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  27.02 
 
 		 591 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  30.89 
 
 		 588 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  29.34 
 
 		 593 aa  171  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.25 
 
 		 614 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.21 
 
 		 613 aa  170  6e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  29.2 
 
 		 608 aa  170  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.78 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  30.16 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  27.89 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  28.28 
 
 		 598 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  27.98 
 
 		 632 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  33.21 
 
 		 587 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  34.33 
 
 		 778 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  28.21 
 
 		 620 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.5 
 
 		 590 aa  166  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  23.96 
 
 		 624 aa  166  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  28.94 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0659  TrkA family protein  30.24 
 
 		 619 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.702121  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  24.95 
 
 		 590 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  28.52 
 
 		 593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>