242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2059 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1981  TrkA domain-containing protein  99.68 
 
 		 620 aa  1236    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0994833  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2059  sulfur deprivation response regulator  100 
 
 		 620 aa  1243    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01839  sulfur deprivation response regulator  84.76 
 
 		 620 aa  1046    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.379301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3192  TrkA-C domain protein  81.6 
 
 		 615 aa  998    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.213915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  39.87 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0233  putative citrate transporter  39.65 
 
 		 627 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  37.56 
 
 		 612 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  37.32 
 
 		 650 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0502  TrkA-C domain protein  37.82 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  32.75 
 
 		 595 aa  279  9e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  33.17 
 
 		 608 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.62 
 
 		 596 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  29.79 
 
 		 602 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  28.88 
 
 		 596 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  28.88 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  29.81 
 
 		 609 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  29.05 
 
 		 597 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.97 
 
 		 613 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  31.05 
 
 		 616 aa  226  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  30.73 
 
 		 604 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  28.43 
 
 		 588 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  29.93 
 
 		 592 aa  215  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  28.2 
 
 		 622 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  29.39 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  28.17 
 
 		 609 aa  213  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 		 588 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  29.52 
 
 		 609 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  27.85 
 
 		 620 aa  203  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  28.81 
 
 		 609 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.97 
 
 		 619 aa  201  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  28.64 
 
 		 609 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  29.19 
 
 		 623 aa  199  9e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  28.83 
 
 		 605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  28.14 
 
 		 609 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  27.86 
 
 		 608 aa  195  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  27.29 
 
 		 621 aa  195  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  27.56 
 
 		 610 aa  194  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  28.93 
 
 		 610 aa  190  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  26.16 
 
 		 632 aa  190  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  26.73 
 
 		 606 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  29.31 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  27.02 
 
 		 609 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  25.56 
 
 		 608 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  26.65 
 
 		 627 aa  187  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  25.94 
 
 		 593 aa  187  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  29.47 
 
 		 618 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  29.04 
 
 		 627 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  25.44 
 
 		 611 aa  184  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  27.4 
 
 		 610 aa  183  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  27.4 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  27.4 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  27.4 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  27.4 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.4 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  25.08 
 
 		 588 aa  181  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  27.86 
 
 		 610 aa  181  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  25.93 
 
 		 630 aa  180  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  25.93 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  25.77 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  27.24 
 
 		 610 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  24.84 
 
 		 605 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  27.09 
 
 		 610 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  25.57 
 
 		 616 aa  177  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  26.73 
 
 		 586 aa  175  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  26.38 
 
 		 610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  27.68 
 
 		 610 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  26.47 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  26.31 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  26.31 
 
 		 608 aa  172  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  25.93 
 
 		 611 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  26.32 
 
 		 614 aa  171  5e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  26.15 
 
 		 608 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  26.15 
 
 		 608 aa  169  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  26.37 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  28.41 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  25.28 
 
 		 593 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  27.36 
 
 		 588 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  25.42 
 
 		 593 aa  167  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  26.21 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  25.04 
 
 		 620 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  28.01 
 
 		 588 aa  167  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  25.21 
 
 		 588 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  23.96 
 
 		 590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  26.18 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  28.64 
 
 		 609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  25.77 
 
 		 591 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  27.01 
 
 		 591 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  28.14 
 
 		 598 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  26.29 
 
 		 600 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  26.28 
 
 		 619 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  25.21 
 
 		 596 aa  161  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  27.61 
 
 		 594 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  26.52 
 
 		 581 aa  160  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  25.65 
 
 		 593 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  24.79 
 
 		 589 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  26.12 
 
 		 592 aa  157  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  24.63 
 
 		 594 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  25.84 
 
 		 599 aa  157  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0621  TrkA family protein  26.44 
 
 		 590 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  24.44 
 
 		 590 aa  155  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>