More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0219 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  100 
 
 		 600 aa  1126    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  54.49 
 
 		 605 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  52.23 
 
 		 604 aa  525  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  44.88 
 
 		 600 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  46.39 
 
 		 612 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  35.92 
 
 		 609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  33.93 
 
 		 613 aa  305  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.28 
 
 		 612 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  35.28 
 
 		 609 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  34.51 
 
 		 609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  34.99 
 
 		 609 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  35.56 
 
 		 610 aa  272  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  30.86 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  34.83 
 
 		 609 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  35.07 
 
 		 610 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  33.01 
 
 		 609 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  48.56 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  30.58 
 
 		 611 aa  260  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  31.52 
 
 		 610 aa  253  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  30.58 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  30.28 
 
 		 610 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  30.12 
 
 		 630 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  30.12 
 
 		 610 aa  249  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  30.65 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  29.47 
 
 		 616 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  32.05 
 
 		 611 aa  244  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  30.86 
 
 		 610 aa  242  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  31.68 
 
 		 593 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  30.58 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  30.58 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.58 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  30.58 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  30.58 
 
 		 610 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  32.94 
 
 		 627 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  30.68 
 
 		 619 aa  239  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  30.13 
 
 		 608 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  30.18 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  30.13 
 
 		 608 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  30.13 
 
 		 608 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  30.13 
 
 		 608 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  30.13 
 
 		 608 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  33.84 
 
 		 609 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  30.42 
 
 		 610 aa  238  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  30.42 
 
 		 610 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  30.65 
 
 		 610 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  29.49 
 
 		 620 aa  234  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  27.18 
 
 		 619 aa  233  7.000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  30.74 
 
 		 608 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  30.02 
 
 		 609 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  30.73 
 
 		 632 aa  227  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.18 
 
 		 588 aa  222  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  30.83 
 
 		 588 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0107  Citrate transporter  33.58 
 
 		 545 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0878847  normal  0.704215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  30.85 
 
 		 605 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  30.63 
 
 		 605 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.16 
 
 		 589 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  33.44 
 
 		 591 aa  213  9e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  31.39 
 
 		 606 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  27.99 
 
 		 597 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  31.14 
 
 		 588 aa  209  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  29.98 
 
 		 612 aa  206  8e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  32.46 
 
 		 604 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  30.59 
 
 		 623 aa  203  7e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  32.63 
 
 		 593 aa  203  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  27.07 
 
 		 602 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  26.9 
 
 		 596 aa  201  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  26.9 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  30.44 
 
 		 591 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  32.58 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  29.67 
 
 		 613 aa  198  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  29.18 
 
 		 641 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  29.02 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  29.77 
 
 		 591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  32.2 
 
 		 616 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  27.09 
 
 		 594 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  33.71 
 
 		 593 aa  195  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  30.58 
 
 		 595 aa  194  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  29.17 
 
 		 588 aa  193  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  30.6 
 
 		 592 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  30.84 
 
 		 591 aa  192  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  27.09 
 
 		 607 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  30.76 
 
 		 596 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  29.19 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  27.92 
 
 		 622 aa  189  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  27.38 
 
 		 596 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  27.2 
 
 		 596 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  29.49 
 
 		 592 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3445  TrkA domain-containing protein  30.08 
 
 		 587 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  29.21 
 
 		 588 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  27.99 
 
 		 627 aa  184  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  29 
 
 		 590 aa  183  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.51 
 
 		 599 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  28.14 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  29.42 
 
 		 614 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2761  uncharacterized transporter  31.42 
 
 		 592 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0332677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0637  membrane transporter  27 
 
 		 620 aa  180  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.797217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  25.45 
 
 		 590 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  25.54 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2292  citrate transporter  32.4 
 
 		 596 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0655867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  27.18 
 
 		 598 aa  177  4e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>