More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0405 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  100 
 
 		 439 aa  862    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  71.46 
 
 		 444 aa  576  1.0000000000000001e-163  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  65.38 
 
 		 436 aa  519  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  62.9 
 
 		 435 aa  508  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  45.69 
 
 		 596 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  29.38 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  30.3 
 
 		 446 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  30.85 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  43.81 
 
 		 599 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  38.96 
 
 		 588 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  30.42 
 
 		 446 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  37.82 
 
 		 602 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  30.89 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  37.39 
 
 		 596 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  44.89 
 
 		 592 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  26.09 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  40.4 
 
 		 592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  44.07 
 
 		 592 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  44.07 
 
 		 592 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  42.79 
 
 		 598 aa  147  4.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  27.95 
 
 		 449 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.77 
 
 		 422 aa  146  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.77 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.77 
 
 		 422 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  41.03 
 
 		 596 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  41.71 
 
 		 588 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.77 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1490  TrkA-C domain protein  44.31 
 
 		 624 aa  143  5e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.149438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  38.34 
 
 		 597 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  27.74 
 
 		 448 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  40.4 
 
 		 593 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  38.81 
 
 		 592 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  38.46 
 
 		 607 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  38.42 
 
 		 579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  37.77 
 
 		 596 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  37.77 
 
 		 596 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  37.76 
 
 		 592 aa  129  7.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  36.55 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  37.81 
 
 		 588 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  40.43 
 
 		 599 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  33.02 
 
 		 594 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  33.64 
 
 		 608 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  34.6 
 
 		 589 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  24.66 
 
 		 422 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  24.43 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  24.43 
 
 		 422 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  38.04 
 
 		 591 aa  123  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  24.43 
 
 		 422 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  40.74 
 
 		 616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  39.07 
 
 		 623 aa  121  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  37.69 
 
 		 591 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  37.85 
 
 		 613 aa  120  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  40 
 
 		 622 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0158  putative transporter  33 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0784692  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  41.33 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  34.93 
 
 		 619 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  32.74 
 
 		 575 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  36.79 
 
 		 616 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  38.69 
 
 		 618 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  40.68 
 
 		 606 aa  116  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  34.83 
 
 		 575 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  34.67 
 
 		 632 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12848  trkA domain protein  31.8 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  33.51 
 
 		 594 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  44.44 
 
 		 574 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  47.66 
 
 		 588 aa  114  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  41.14 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  34.57 
 
 		 605 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  41.14 
 
 		 592 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  34.57 
 
 		 605 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  34.41 
 
 		 609 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  34.57 
 
 		 588 aa  113  6e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  37.31 
 
 		 620 aa  113  6e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  40.7 
 
 		 627 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  32.04 
 
 		 574 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  39.34 
 
 		 611 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  35.03 
 
 		 574 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  41.42 
 
 		 593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  43.26 
 
 		 574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  33.82 
 
 		 612 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  38.8 
 
 		 609 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  30.95 
 
 		 618 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  32.52 
 
 		 574 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  35.05 
 
 		 512 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  40.57 
 
 		 621 aa  110  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  33.87 
 
 		 583 aa  110  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  32.72 
 
 		 613 aa  110  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  34.17 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  31.55 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.19 
 
 		 589 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.02 
 
 		 601 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  35.47 
 
 		 609 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  37.06 
 
 		 575 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  38.68 
 
 		 627 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  31.03 
 
 		 605 aa  107  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  37.76 
 
 		 574 aa  106  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  37.7 
 
 		 610 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  35.2 
 
 		 778 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  38.46 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02561  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  35.23 
 
 		 606 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>