More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2656 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  100 
 
 
414 aa  814    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  52.49 
 
 
448 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  53.01 
 
 
446 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  53.25 
 
 
446 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  53.52 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  50.36 
 
 
447 aa  414  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  50.12 
 
 
449 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  38.66 
 
 
422 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  39 
 
 
422 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  39.05 
 
 
422 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  38.81 
 
 
422 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  38.81 
 
 
422 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  34.28 
 
 
422 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  34.28 
 
 
422 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  34.28 
 
 
422 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  34.04 
 
 
422 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  40.28 
 
 
613 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  29 
 
 
435 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  40.61 
 
 
588 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  29.6 
 
 
436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  37.33 
 
 
609 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  42.63 
 
 
609 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  36.87 
 
 
612 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  39.82 
 
 
616 aa  159  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  36 
 
 
512 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  29.83 
 
 
444 aa  156  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  31.09 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  37.5 
 
 
600 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  40.61 
 
 
588 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.87 
 
 
456 aa  151  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  40.7 
 
 
619 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  38.6 
 
 
621 aa  149  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  35.9 
 
 
604 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  38.74 
 
 
610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  38.74 
 
 
630 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  38.74 
 
 
610 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  38.3 
 
 
609 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  29.46 
 
 
460 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  36.32 
 
 
602 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  37.62 
 
 
596 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.94 
 
 
459 aa  144  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  29.9 
 
 
456 aa  143  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  38.22 
 
 
611 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  37.31 
 
 
620 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  28.06 
 
 
462 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  38.83 
 
 
609 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  38.83 
 
 
609 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  34.26 
 
 
610 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  39.25 
 
 
594 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  27.13 
 
 
502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  37.57 
 
 
609 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  27.83 
 
 
456 aa  137  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  37.99 
 
 
627 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  34.17 
 
 
588 aa  137  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  39.11 
 
 
605 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  28.35 
 
 
455 aa  136  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  26.72 
 
 
456 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  34.15 
 
 
607 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  28.07 
 
 
464 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  29.93 
 
 
483 aa  136  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  34.33 
 
 
598 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  28.26 
 
 
453 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  26.89 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  26.89 
 
 
466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  27.25 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  27.25 
 
 
466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  37.56 
 
 
593 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  38.22 
 
 
610 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  28.54 
 
 
522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  33.91 
 
 
778 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  38.14 
 
 
610 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  27.23 
 
 
466 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  38.14 
 
 
610 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  26.37 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  38.22 
 
 
608 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  34.36 
 
 
591 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  28.96 
 
 
610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  38.22 
 
 
608 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  34.07 
 
 
610 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  34.07 
 
 
610 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.07 
 
 
610 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  34.07 
 
 
610 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  34.07 
 
 
610 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  34.07 
 
 
610 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  39.58 
 
 
612 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  35.71 
 
 
591 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  30.58 
 
 
599 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  27.53 
 
 
466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  26.23 
 
 
513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  26.59 
 
 
474 aa  130  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  35.78 
 
 
596 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  39.27 
 
 
610 aa  130  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  25.83 
 
 
463 aa  130  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  34.09 
 
 
597 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  29.21 
 
 
610 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  26.59 
 
 
458 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  35.78 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  34.26 
 
 
610 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  27.18 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  25.88 
 
 
464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>