More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_0451 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  77.02 
 
 
465 aa  716    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  92.49 
 
 
466 aa  855    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  92.06 
 
 
466 aa  851    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  92.49 
 
 
466 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  97.42 
 
 
467 aa  878    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  96.99 
 
 
467 aa  876    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  79.57 
 
 
464 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  92.27 
 
 
466 aa  848    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  100 
 
 
466 aa  920    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  80.26 
 
 
464 aa  749    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  91.85 
 
 
466 aa  851    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  75.69 
 
 
463 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  61.99 
 
 
456 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  61.31 
 
 
456 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  59.35 
 
 
462 aa  511  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  57.62 
 
 
457 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  51.78 
 
 
462 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  53.98 
 
 
455 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  57.35 
 
 
459 aa  458  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  57.11 
 
 
459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  52.74 
 
 
473 aa  450  1e-125  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  54.55 
 
 
482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  51.48 
 
 
474 aa  442  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  51.56 
 
 
453 aa  443  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  49.34 
 
 
456 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  43.79 
 
 
460 aa  385  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  42.22 
 
 
456 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  45.17 
 
 
476 aa  349  7e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  48.74 
 
 
442 aa  286  5e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  33.95 
 
 
552 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  38.05 
 
 
522 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  33.2 
 
 
536 aa  224  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  33.26 
 
 
483 aa  223  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  34.99 
 
 
487 aa  219  7.999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  36.08 
 
 
478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  33.54 
 
 
522 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  32.75 
 
 
502 aa  212  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  34.2 
 
 
458 aa  209  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  32.13 
 
 
660 aa  206  5e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  33.49 
 
 
607 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  34.24 
 
 
490 aa  203  6e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  35.85 
 
 
483 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  33.75 
 
 
509 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  35.96 
 
 
486 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  34.75 
 
 
506 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  34.67 
 
 
486 aa  193  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  34.55 
 
 
557 aa  193  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  33.26 
 
 
520 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  33.26 
 
 
520 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  33.2 
 
 
540 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  30.9 
 
 
487 aa  190  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  33.83 
 
 
499 aa  187  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  33.56 
 
 
468 aa  187  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  32.07 
 
 
513 aa  186  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  34.9 
 
 
491 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  32.09 
 
 
531 aa  182  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  32.04 
 
 
467 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  31.79 
 
 
491 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  37.53 
 
 
485 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  34.91 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  31.95 
 
 
566 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  30.49 
 
 
487 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  33.19 
 
 
596 aa  174  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  34.72 
 
 
481 aa  172  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  33.04 
 
 
534 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  33.04 
 
 
534 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  33.04 
 
 
534 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  31.25 
 
 
482 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  33.95 
 
 
543 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  34.22 
 
 
509 aa  169  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  31.85 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  28.76 
 
 
447 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  29.6 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  31.26 
 
 
482 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  30.7 
 
 
498 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  32.29 
 
 
517 aa  159  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  31.02 
 
 
474 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.46 
 
 
459 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  32.27 
 
 
516 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  29.43 
 
 
533 aa  157  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  35.84 
 
 
511 aa  156  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  31.91 
 
 
502 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  28.18 
 
 
475 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  27.96 
 
 
572 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  30.41 
 
 
466 aa  150  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  33.97 
 
 
495 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  29.9 
 
 
483 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  33.7 
 
 
472 aa  148  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  28.29 
 
 
483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  34.69 
 
 
579 aa  147  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  30.47 
 
 
471 aa  143  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  31.55 
 
 
471 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.42 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  27.79 
 
 
467 aa  141  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  29.31 
 
 
570 aa  140  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  27.78 
 
 
448 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  28.44 
 
 
454 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  27.73 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  27.96 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  27.96 
 
 
422 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>