More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1945 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  100 
 
 		 778 aa  1529    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  38.03 
 
 		 588 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  35.61 
 
 		 612 aa  226  9e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  35.88 
 
 		 619 aa  226  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  35.26 
 
 		 597 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  35.03 
 
 		 602 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  35.31 
 
 		 596 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  35.54 
 
 		 613 aa  222  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  35.29 
 
 		 609 aa  221  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  33.78 
 
 		 598 aa  219  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  34.22 
 
 		 596 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  34.22 
 
 		 608 aa  216  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.95 
 
 		 596 aa  216  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  35.45 
 
 		 609 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  36.98 
 
 		 609 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  36.2 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  36.1 
 
 		 609 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  36.1 
 
 		 609 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  35.79 
 
 		 620 aa  209  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  36.41 
 
 		 610 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  35.64 
 
 		 611 aa  208  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  36.41 
 
 		 610 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  36.41 
 
 		 630 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  38.16 
 
 		 610 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  38.16 
 
 		 610 aa  207  8e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  36.24 
 
 		 627 aa  205  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1390  citrate transporter  38.34 
 
 		 581 aa  205  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  34.91 
 
 		 609 aa  203  8e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  38.03 
 
 		 610 aa  203  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2586  TrkA domain-containing protein  34.95 
 
 		 605 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  34.22 
 
 		 610 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  34.33 
 
 		 588 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  35.12 
 
 		 593 aa  198  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  37.23 
 
 		 610 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  34.92 
 
 		 609 aa  197  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0636  Citrate transporter  33.33 
 
 		 616 aa  197  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.315061  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  33.84 
 
 		 616 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  38.56 
 
 		 619 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  31.06 
 
 		 596 aa  195  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  33.61 
 
 		 589 aa  191  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  33.07 
 
 		 592 aa  190  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  34.22 
 
 		 610 aa  187  6e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.22 
 
 		 610 aa  187  6e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  34.22 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  34.22 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  34.22 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  34.22 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  34.22 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.22 
 
 		 610 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2565  Citrate transporter  32.8 
 
 		 612 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000262812  hitchhiker  0.00846498 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  32.84 
 
 		 601 aa  185  3e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  35.09 
 
 		 591 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  31.18 
 
 		 592 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1177  Citrate transporter  35.16 
 
 		 604 aa  184  8.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.437417  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  31.18 
 
 		 592 aa  183  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  34.22 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  34.22 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  34.22 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  34.22 
 
 		 608 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  34.22 
 
 		 608 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  32.98 
 
 		 605 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1447  putative sodium/sulfate transporter, DASS family  32.98 
 
 		 605 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.629217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  35.03 
 
 		 610 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 592 aa  182  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  33.08 
 
 		 621 aa  181  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2399  TrkA domain-containing protein  32.09 
 
 		 608 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.9987  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  31.85 
 
 		 608 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  32.02 
 
 		 622 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  35.36 
 
 		 611 aa  181  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 		 588 aa  181  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  31.62 
 
 		 599 aa  181  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  34.1 
 
 		 606 aa  180  9e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  35.15 
 
 		 588 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  40.21 
 
 		 609 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  34.56 
 
 		 605 aa  178  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  32.43 
 
 		 593 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3239  TrkA-C domain protein  31.2 
 
 		 613 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0010645  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  33.87 
 
 		 627 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  28.72 
 
 		 592 aa  176  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0357  citrate transporter  31.66 
 
 		 595 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.152666  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.04 
 
 		 618 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  30.91 
 
 		 599 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  32.88 
 
 		 618 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  33.16 
 
 		 600 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  31.28 
 
 		 593 aa  174  6.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  31.3 
 
 		 590 aa  174  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  35.04 
 
 		 605 aa  173  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  32.8 
 
 		 592 aa  173  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  30.62 
 
 		 592 aa  173  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  30.65 
 
 		 594 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.18 
 
 		 588 aa  171  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0086  DASS family sodium/sulfate transporter  32.69 
 
 		 602 aa  171  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121034  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  31.82 
 
 		 591 aa  171  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00921  DASS family sodium/sulfate transporter  32.64 
 
 		 609 aa  170  8e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.61 
 
 		 607 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  31.52 
 
 		 605 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00951  DASS family sodium/sulfate transporter  32.97 
 
 		 602 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.8674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1728  citrate transporter  29.11 
 
 		 650 aa  167  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000373143  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  31.62 
 
 		 588 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00961  DASS family sodium/sulfate transporter  32.69 
 
 		 602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.531259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>