More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0219 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  100 
 
 
462 aa  911    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  65.43 
 
 
455 aa  593  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  62.17 
 
 
453 aa  555  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  59.33 
 
 
456 aa  545  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  57.11 
 
 
482 aa  489  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  58.04 
 
 
459 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  51.97 
 
 
466 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  51.97 
 
 
466 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  51.97 
 
 
466 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  56.74 
 
 
459 aa  476  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  51.52 
 
 
457 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  51.97 
 
 
466 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  51.52 
 
 
456 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  56.65 
 
 
474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  53.9 
 
 
466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  56.55 
 
 
473 aa  462  1e-129  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  51.78 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  51.56 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  52 
 
 
466 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  51.09 
 
 
456 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  50.11 
 
 
465 aa  457  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  50.22 
 
 
464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  50.44 
 
 
463 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  49.67 
 
 
464 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  49.78 
 
 
462 aa  431  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  45.91 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  51.3 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  40.64 
 
 
456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  43.58 
 
 
442 aa  256  4e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  38.07 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  36.29 
 
 
522 aa  233  5e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  36.12 
 
 
483 aa  233  6e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  33.8 
 
 
536 aa  229  8e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  32.85 
 
 
490 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  37.23 
 
 
483 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  31.85 
 
 
552 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  34.66 
 
 
487 aa  203  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  34.49 
 
 
491 aa  202  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  36.36 
 
 
486 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  30.68 
 
 
660 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  33.76 
 
 
513 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  35.06 
 
 
522 aa  196  7e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  32.33 
 
 
531 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  32.51 
 
 
607 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  32.66 
 
 
520 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  32.66 
 
 
520 aa  192  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  33.73 
 
 
540 aa  189  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  35.28 
 
 
478 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  35.62 
 
 
493 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  33.03 
 
 
458 aa  187  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.23 
 
 
487 aa  187  5e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  36.28 
 
 
486 aa  186  7e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  33.11 
 
 
557 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  36.59 
 
 
516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  32.98 
 
 
506 aa  184  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  31.45 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  31.34 
 
 
509 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  33.74 
 
 
509 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  32.5 
 
 
468 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  31.72 
 
 
596 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  30.84 
 
 
447 aa  171  3e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  31.58 
 
 
499 aa  169  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  34.66 
 
 
481 aa  168  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  30.06 
 
 
531 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  33.06 
 
 
566 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  32.38 
 
 
534 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.16 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.16 
 
 
534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  29.24 
 
 
572 aa  163  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  34.37 
 
 
485 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  34.99 
 
 
517 aa  159  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  35.74 
 
 
495 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  28.31 
 
 
491 aa  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.66 
 
 
487 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  28.84 
 
 
472 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  29.73 
 
 
498 aa  150  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  30.7 
 
 
482 aa  149  9e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  30.17 
 
 
570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  29.02 
 
 
448 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  29.44 
 
 
466 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  31.85 
 
 
579 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  32.64 
 
 
511 aa  146  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  29.41 
 
 
543 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  26.88 
 
 
449 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.43 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  27.25 
 
 
474 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.33 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  27.45 
 
 
422 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  30.53 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  30 
 
 
471 aa  134  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.23 
 
 
482 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  29.66 
 
 
471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  27.71 
 
 
467 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  27 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  27 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  26.76 
 
 
422 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  26.76 
 
 
422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  30.91 
 
 
454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  28.98 
 
 
450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  26.91 
 
 
534 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>