More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1359 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  100 
 
 
534 aa  1062    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  34.25 
 
 
488 aa  231  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  30.18 
 
 
452 aa  192  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.9 
 
 
482 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  27.44 
 
 
483 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.01 
 
 
446 aa  166  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.82 
 
 
459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  26.49 
 
 
456 aa  164  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  27.71 
 
 
456 aa  161  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  28.93 
 
 
455 aa  159  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  29.05 
 
 
491 aa  154  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  28.57 
 
 
618 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  25.71 
 
 
466 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  25.71 
 
 
466 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  25.53 
 
 
464 aa  137  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  25.47 
 
 
466 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  25.47 
 
 
466 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  24.27 
 
 
482 aa  136  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  25.64 
 
 
453 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  24.83 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  26.9 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  25.24 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  25.06 
 
 
466 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.4 
 
 
514 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.76 
 
 
465 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  26.27 
 
 
482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.85 
 
 
475 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  24.64 
 
 
464 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  23.28 
 
 
457 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  25.93 
 
 
498 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  25.3 
 
 
467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  27.47 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  25.06 
 
 
456 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  26.54 
 
 
459 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  25.06 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  25.3 
 
 
466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  26.89 
 
 
459 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  26.28 
 
 
470 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  26.06 
 
 
516 aa  126  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.08 
 
 
483 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  23.4 
 
 
462 aa  124  6e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  25.46 
 
 
460 aa  123  9e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  29.67 
 
 
688 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  24.09 
 
 
473 aa  121  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  24.7 
 
 
474 aa  121  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.77 
 
 
482 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.38 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  25.85 
 
 
458 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  26.52 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  26.52 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  26.59 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  25.39 
 
 
461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  26.52 
 
 
422 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  26.52 
 
 
422 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  24.8 
 
 
536 aa  114  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  26.35 
 
 
466 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  29.22 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  26.19 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  25.51 
 
 
490 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.14 
 
 
486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  28.6 
 
 
513 aa  110  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  25.95 
 
 
483 aa  109  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  23.7 
 
 
531 aa  107  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  26.2 
 
 
522 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  23.98 
 
 
607 aa  106  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  26.99 
 
 
499 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  25.18 
 
 
476 aa  103  6e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  22.73 
 
 
531 aa  103  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  28.21 
 
 
570 aa  102  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  25 
 
 
468 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  28.24 
 
 
493 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  25.52 
 
 
461 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  26.65 
 
 
482 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.37 
 
 
543 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  24.94 
 
 
487 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  26.24 
 
 
448 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.06 
 
 
491 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  24.78 
 
 
507 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  26.35 
 
 
487 aa  98.6  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  22.57 
 
 
491 aa  97.4  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  25.75 
 
 
506 aa  97.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  23.72 
 
 
509 aa  97.1  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.21 
 
 
526 aa  97.1  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  27.27 
 
 
476 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  27.27 
 
 
476 aa  96.7  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  23.62 
 
 
533 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  24.04 
 
 
660 aa  95.5  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  26.09 
 
 
473 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.26 
 
 
476 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  26.55 
 
 
509 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.84 
 
 
489 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.14 
 
 
493 aa  94.4  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  27.21 
 
 
447 aa  93.2  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  24.27 
 
 
471 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  24.14 
 
 
472 aa  92  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  24.42 
 
 
520 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  24.83 
 
 
472 aa  91.3  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  24.42 
 
 
520 aa  91.3  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  23.88 
 
 
486 aa  90.9  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  24.65 
 
 
442 aa  90.5  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>