More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1048 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  100 
 
 		 473 aa  924    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  75.37 
 
 		 482 aa  717    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  96.41 
 
 		 474 aa  869    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  56.55 
 
 		 462 aa  480  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  55.33 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  55.33 
 
 		 466 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  55.11 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  55.11 
 
 		 466 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  54.27 
 
 		 455 aa  465  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  56.05 
 
 		 466 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  52.16 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  54.12 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  54.34 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  52.74 
 
 		 466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  55.63 
 
 		 476 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  54.65 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  51.56 
 
 		 456 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  51.66 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  50.9 
 
 		 456 aa  441  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  53.3 
 
 		 453 aa  442  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  54.5 
 
 		 464 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  55.9 
 
 		 459 aa  435  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  56.03 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  53.56 
 
 		 457 aa  430  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  51.75 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  52.22 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  47.3 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  39.59 
 
 		 456 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  46.62 
 
 		 442 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  35.92 
 
 		 536 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  38 
 
 		 458 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  36.56 
 
 		 502 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  33.47 
 
 		 552 aa  226  7e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  34.79 
 
 		 483 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  35.06 
 
 		 490 aa  223  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  36.21 
 
 		 483 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  34.04 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  34.74 
 
 		 478 aa  216  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  35.23 
 
 		 487 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  37.61 
 
 		 522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  35.59 
 
 		 607 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  34.99 
 
 		 660 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  33.64 
 
 		 467 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  37.19 
 
 		 513 aa  207  3e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  34.58 
 
 		 506 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.3 
 
 		 487 aa  206  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  34.55 
 
 		 557 aa  206  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  36.36 
 
 		 486 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  35.75 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  36.75 
 
 		 509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  34.73 
 
 		 531 aa  197  5.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  35.81 
 
 		 481 aa  194  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  34.65 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  30.84 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  35.57 
 
 		 486 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  30.84 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  32.53 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  36.19 
 
 		 516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  33.8 
 
 		 468 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  30.86 
 
 		 509 aa  180  4.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  32.56 
 
 		 533 aa  177  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  34.52 
 
 		 493 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  32.76 
 
 		 531 aa  177  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  30.55 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  35.79 
 
 		 485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  32.36 
 
 		 466 aa  173  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  33.19 
 
 		 502 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  32.83 
 
 		 499 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  28.25 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  35.1 
 
 		 517 aa  167  5e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  32.05 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  31.95 
 
 		 487 aa  163  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  32.14 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  34.35 
 
 		 471 aa  162  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  32.66 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.66 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.66 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  33.33 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  30.53 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  30.98 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  33.69 
 
 		 579 aa  157  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  33.69 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  36.57 
 
 		 495 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  30.22 
 
 		 422 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.98 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  31.65 
 
 		 478 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  30.16 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  34.05 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  28.67 
 
 		 459 aa  147  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  30 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  28.54 
 
 		 422 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  28.54 
 
 		 422 aa  143  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  28.54 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  28.54 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.88 
 
 		 483 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  27.44 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  28.71 
 
 		 448 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  32.77 
 
 		 471 aa  136  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  27.85 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  27.29 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>