More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1358 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  100 
 
 		 467 aa  913    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  52.53 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  50.64 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  44.4 
 
 		 502 aa  342  7e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  40.29 
 
 		 490 aa  317  3e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  41.18 
 
 		 522 aa  301  1e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  39.64 
 
 		 520 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  39.64 
 
 		 520 aa  292  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  39.11 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  38.29 
 
 		 509 aa  290  5.0000000000000004e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  41.23 
 
 		 486 aa  290  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  41.08 
 
 		 557 aa  289  7e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  42.23 
 
 		 513 aa  289  7e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  39.09 
 
 		 487 aa  287  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  39.54 
 
 		 531 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  37.83 
 
 		 572 aa  283  5.000000000000001e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  36.17 
 
 		 660 aa  276  5e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  38.64 
 
 		 607 aa  276  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  39.37 
 
 		 506 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  39.46 
 
 		 540 aa  266  5e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  45.35 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  39.04 
 
 		 596 aa  257  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  39.5 
 
 		 491 aa  257  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  38.49 
 
 		 533 aa  256  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  41.26 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  35.45 
 
 		 552 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  37.87 
 
 		 483 aa  250  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  36.99 
 
 		 468 aa  248  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  42.34 
 
 		 516 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  35.07 
 
 		 566 aa  246  6.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  38.29 
 
 		 517 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  38.98 
 
 		 495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  38.27 
 
 		 493 aa  241  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  37.41 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  37.66 
 
 		 509 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  33.7 
 
 		 466 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  37.75 
 
 		 486 aa  230  5e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  34.25 
 
 		 455 aa  222  9e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  36.64 
 
 		 457 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  33.86 
 
 		 482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  33.98 
 
 		 456 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  33.87 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  33.76 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  34.32 
 
 		 453 aa  213  7e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  33.94 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  37.12 
 
 		 454 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  38.66 
 
 		 502 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  33.68 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  37.25 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  31.54 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  31.54 
 
 		 466 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  31.54 
 
 		 466 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  31.54 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  33.13 
 
 		 531 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  31.88 
 
 		 462 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  30.98 
 
 		 456 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  32.11 
 
 		 466 aa  196  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  33.69 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  32.87 
 
 		 456 aa  196  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  32.47 
 
 		 499 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  33.41 
 
 		 465 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  32.12 
 
 		 463 aa  193  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  32.31 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  32.31 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  32.31 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  32.49 
 
 		 464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  31.81 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  33.41 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  31.35 
 
 		 467 aa  186  9e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  31.08 
 
 		 487 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  33.18 
 
 		 450 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  31.35 
 
 		 467 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  34.47 
 
 		 476 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  33.03 
 
 		 459 aa  183  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  31.35 
 
 		 460 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  32.09 
 
 		 467 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  32.79 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  31.02 
 
 		 543 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  32.39 
 
 		 487 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  31.51 
 
 		 472 aa  166  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  31.03 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  30.99 
 
 		 478 aa  156  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  31.86 
 
 		 474 aa  156  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  31.11 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  36.45 
 
 		 442 aa  150  5e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.88 
 
 		 475 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.38 
 
 		 472 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  30.12 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.51 
 
 		 446 aa  140  6e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  30.49 
 
 		 491 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  31.95 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.83 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  27.91 
 
 		 511 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  25.56 
 
 		 498 aa  123  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  26.69 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  23.49 
 
 		 452 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  27.19 
 
 		 516 aa  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  29.93 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  26.73 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  27.01 
 
 		 449 aa  114  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>