267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2343 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003586  transporter  68.01 
 
 
472 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  76.91 
 
 
472 aa  673    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  100 
 
 
471 aa  920    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  70.76 
 
 
474 aa  638    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  68.31 
 
 
487 aa  633  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  57.48 
 
 
471 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  56.96 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  55.63 
 
 
478 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  57.54 
 
 
579 aa  439  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  45.38 
 
 
491 aa  416  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  35.7 
 
 
482 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  36.64 
 
 
511 aa  240  5e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  30.34 
 
 
502 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  31.42 
 
 
522 aa  170  5e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  31.08 
 
 
483 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  33.16 
 
 
483 aa  163  7e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  31.46 
 
 
466 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  33.68 
 
 
465 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  31.24 
 
 
466 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  31 
 
 
466 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  31.24 
 
 
466 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  32.02 
 
 
466 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  35.29 
 
 
486 aa  160  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  30.72 
 
 
552 aa  160  7e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  34.02 
 
 
482 aa  157  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  32.14 
 
 
464 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  31.15 
 
 
487 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  33.33 
 
 
466 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  30.08 
 
 
557 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  32.39 
 
 
474 aa  155  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  32.8 
 
 
467 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  28.41 
 
 
536 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  30.24 
 
 
506 aa  154  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  31.13 
 
 
513 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  32.54 
 
 
467 aa  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  31.88 
 
 
487 aa  153  8e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  32.36 
 
 
463 aa  153  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  31.24 
 
 
473 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  32.82 
 
 
464 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00469  phosphate transport (Eurofung)  31.89 
 
 
1113 aa  150  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86239  phosphate permease  32.82 
 
 
963 aa  150  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.182724  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  31.49 
 
 
486 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  32.64 
 
 
457 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  29.52 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  33.68 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  33.78 
 
 
453 aa  147  3e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  31.92 
 
 
462 aa  147  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  30 
 
 
516 aa  146  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.11 
 
 
456 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  30.31 
 
 
456 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  29.28 
 
 
520 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  29.28 
 
 
520 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  30.5 
 
 
481 aa  143  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  29.32 
 
 
490 aa  143  7e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  31.43 
 
 
455 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83361  low-affinity phosphate transporter  29.21 
 
 
837 aa  140  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  29.51 
 
 
456 aa  140  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  26.93 
 
 
572 aa  138  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  28.48 
 
 
607 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  27.13 
 
 
660 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  30.09 
 
 
460 aa  137  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  29.67 
 
 
522 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03570  phosphate transporter, putative  30.73 
 
 
952 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  29.6 
 
 
482 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  31.03 
 
 
509 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  29.71 
 
 
566 aa  134  3.9999999999999996e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  31.5 
 
 
485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  27.59 
 
 
531 aa  134  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  34.2 
 
 
462 aa  133  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  29.46 
 
 
517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  28.17 
 
 
447 aa  131  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  30.38 
 
 
458 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  33.08 
 
 
467 aa  130  6e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  30.59 
 
 
499 aa  127  4.0000000000000003e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.92 
 
 
491 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  29.25 
 
 
570 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  35.78 
 
 
540 aa  123  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  27.68 
 
 
596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  30.04 
 
 
493 aa  121  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  29.04 
 
 
502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  30.61 
 
 
467 aa  120  6e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  26.44 
 
 
531 aa  120  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  30.03 
 
 
459 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  28.6 
 
 
516 aa  117  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  31.73 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  26.61 
 
 
483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  29.77 
 
 
459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.98 
 
 
446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  27.37 
 
 
468 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  28.54 
 
 
478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  27.03 
 
 
543 aa  114  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  27.06 
 
 
483 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.3 
 
 
491 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  26.72 
 
 
498 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  27.79 
 
 
466 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  29.52 
 
 
495 aa  110  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  24.66 
 
 
452 aa  109  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  30.93 
 
 
450 aa  108  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  29.19 
 
 
534 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  29.19 
 
 
534 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>