More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3450 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  100 
 
 
511 aa  991    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  39.18 
 
 
482 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  37.55 
 
 
471 aa  272  9e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  37.23 
 
 
471 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  36.96 
 
 
487 aa  266  5e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  37.61 
 
 
478 aa  264  3e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  36.77 
 
 
472 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  33.94 
 
 
491 aa  248  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  35.99 
 
 
474 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  35.7 
 
 
471 aa  243  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  36.47 
 
 
472 aa  241  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  39.58 
 
 
579 aa  239  1e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  35.39 
 
 
466 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  35.39 
 
 
466 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  35.39 
 
 
466 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  35.16 
 
 
466 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  34.93 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  36.07 
 
 
466 aa  173  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  35.16 
 
 
467 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  35.84 
 
 
467 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  33.41 
 
 
487 aa  166  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  32.64 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  33.89 
 
 
465 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.76 
 
 
456 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  33.79 
 
 
464 aa  163  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  31.63 
 
 
456 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  28.45 
 
 
487 aa  159  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  28.38 
 
 
520 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  28.38 
 
 
520 aa  158  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  33.64 
 
 
464 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  33.94 
 
 
463 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  30.91 
 
 
482 aa  156  8e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  30.05 
 
 
483 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  29.71 
 
 
455 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  34.76 
 
 
486 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  30.21 
 
 
457 aa  153  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  30.19 
 
 
474 aa  151  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  30.82 
 
 
502 aa  150  7e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  29.58 
 
 
536 aa  150  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  30.79 
 
 
456 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  31.61 
 
 
506 aa  149  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  30.43 
 
 
473 aa  147  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  32.51 
 
 
493 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  30.47 
 
 
453 aa  147  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  31.07 
 
 
513 aa  147  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  32.28 
 
 
462 aa  145  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  28.08 
 
 
456 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  27.8 
 
 
552 aa  144  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00469  phosphate transport (Eurofung)  29.87 
 
 
1113 aa  143  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  30.19 
 
 
557 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  31.39 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  31.02 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  29.86 
 
 
483 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  29.69 
 
 
460 aa  139  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  29.71 
 
 
509 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  31.61 
 
 
540 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83361  low-affinity phosphate transporter  29.71 
 
 
837 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  31.45 
 
 
491 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  32.18 
 
 
522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.8 
 
 
446 aa  133  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  28.9 
 
 
478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  30.23 
 
 
516 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  31.38 
 
 
481 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  35.28 
 
 
442 aa  129  9.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  29.51 
 
 
458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  27.29 
 
 
522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03570  phosphate transporter, putative  28.92 
 
 
952 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.626878  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  27.83 
 
 
572 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  29.14 
 
 
531 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  28.1 
 
 
531 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  32.46 
 
 
495 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  32.2 
 
 
459 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  29.1 
 
 
476 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  29.56 
 
 
607 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  27.75 
 
 
467 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  32.05 
 
 
459 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  29.17 
 
 
466 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  29.63 
 
 
660 aa  120  7e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  29.96 
 
 
566 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86239  phosphate permease  25.29 
 
 
963 aa  119  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.182724  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  28.79 
 
 
517 aa  118  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  31.52 
 
 
509 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  27.89 
 
 
516 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  26.52 
 
 
482 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  28.16 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  29.55 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  32.28 
 
 
485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  28.57 
 
 
447 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  30.17 
 
 
596 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  29.05 
 
 
468 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  28.14 
 
 
543 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  29.09 
 
 
449 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  26.17 
 
 
618 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  28.31 
 
 
446 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.15 
 
 
459 aa  107  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  25.38 
 
 
483 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  27.03 
 
 
447 aa  103  6e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  26.19 
 
 
452 aa  103  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  25.56 
 
 
422 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.95 
 
 
483 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>