More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0778 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  100 
 
 		 459 aa  895    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  99.56 
 
 		 459 aa  891    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  56.74 
 
 		 462 aa  528  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  57.17 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  55.56 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  55.56 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  55.95 
 
 		 466 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  55.95 
 
 		 466 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  56.11 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  55.19 
 
 		 457 aa  496  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  53.96 
 
 		 464 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  54.19 
 
 		 467 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  54.98 
 
 		 456 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  55.73 
 
 		 466 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  54.19 
 
 		 467 aa  490  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  53.83 
 
 		 465 aa  490  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  55.07 
 
 		 466 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  54.63 
 
 		 462 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  53.44 
 
 		 463 aa  483  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  54.82 
 
 		 464 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  54.91 
 
 		 482 aa  478  1e-133  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  55.63 
 
 		 456 aa  466  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  53.56 
 
 		 453 aa  463  1e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  53.9 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  53.33 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  48.66 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  53.19 
 
 		 476 aa  385  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  38.88 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  48.81 
 
 		 442 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  36.34 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  35.21 
 
 		 483 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  32.9 
 
 		 522 aa  217  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  36.3 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  33.67 
 
 		 536 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  34.86 
 
 		 607 aa  210  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  33.2 
 
 		 660 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  35.97 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  34.55 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  35.85 
 
 		 483 aa  202  8e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  35.79 
 
 		 486 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  37.47 
 
 		 487 aa  200  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  33.74 
 
 		 552 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  34.25 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  33.76 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  32.04 
 
 		 513 aa  196  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  33.61 
 
 		 531 aa  193  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  35.27 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  33.72 
 
 		 467 aa  191  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  34.74 
 
 		 557 aa  190  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  35.06 
 
 		 486 aa  188  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  35.03 
 
 		 522 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  30.77 
 
 		 487 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  33.04 
 
 		 520 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  33.04 
 
 		 520 aa  182  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  35.96 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  33.19 
 
 		 499 aa  180  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  33.4 
 
 		 509 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  33.61 
 
 		 596 aa  175  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  35.94 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  38.28 
 
 		 485 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  32.37 
 
 		 509 aa  170  5e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  37.02 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  30.77 
 
 		 531 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  35 
 
 		 533 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  33.85 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  37.32 
 
 		 481 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  27.9 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  30.87 
 
 		 566 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  31.57 
 
 		 534 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  31.07 
 
 		 466 aa  153  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  30.08 
 
 		 487 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  35.71 
 
 		 495 aa  152  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  31.35 
 
 		 534 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  31.35 
 
 		 534 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  29.19 
 
 		 491 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  26.49 
 
 		 475 aa  149  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  31.46 
 
 		 474 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  28.51 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  32.21 
 
 		 471 aa  143  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  31.43 
 
 		 471 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  27.03 
 
 		 534 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  30.65 
 
 		 449 aa  140  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  30.89 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  27.29 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.51 
 
 		 446 aa  136  9e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.84 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  29.07 
 
 		 543 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.61 
 
 		 472 aa  134  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  27.34 
 
 		 448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  32.21 
 
 		 579 aa  132  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.4 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  26.28 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  27.67 
 
 		 482 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  31.54 
 
 		 478 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  27.27 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  28.64 
 
 		 482 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  27.43 
 
 		 467 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  27.01 
 
 		 446 aa  123  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  27.63 
 
 		 447 aa  123  8e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  27.03 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>