More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3246 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  100 
 
 		 506 aa  978    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  48.33 
 
 		 483 aa  457  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  50 
 
 		 486 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  47.57 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  49.8 
 
 		 487 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  49.79 
 
 		 491 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  47.95 
 
 		 531 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  47.88 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  44.22 
 
 		 552 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  44.51 
 
 		 660 aa  387  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  46.5 
 
 		 540 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  45.88 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  44.68 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  44.68 
 
 		 557 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  44.56 
 
 		 607 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  48.41 
 
 		 533 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  53.23 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  48.9 
 
 		 486 aa  364  2e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  41.47 
 
 		 502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  43.37 
 
 		 509 aa  360  4e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  49.45 
 
 		 495 aa  355  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  48.56 
 
 		 502 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  43.6 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  43.6 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  39.73 
 
 		 522 aa  351  2e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  48.21 
 
 		 517 aa  350  3e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  48.59 
 
 		 481 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  44.56 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  43.39 
 
 		 509 aa  320  3e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  40.79 
 
 		 513 aa  319  6e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  41.82 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  38.52 
 
 		 572 aa  302  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  44.26 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  38.31 
 
 		 478 aa  290  4e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  38.75 
 
 		 466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  39.53 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  39.37 
 
 		 467 aa  283  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  38.23 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  32.88 
 
 		 536 aa  240  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  36.57 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  32.61 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  37.09 
 
 		 455 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  35.43 
 
 		 482 aa  218  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  36.05 
 
 		 473 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  35.52 
 
 		 465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  32.24 
 
 		 456 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  36.19 
 
 		 463 aa  212  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  36.51 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  36.51 
 
 		 466 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  36.51 
 
 		 466 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  35.68 
 
 		 464 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  36.51 
 
 		 466 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  35.75 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  36.68 
 
 		 467 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  36.47 
 
 		 466 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  36.68 
 
 		 467 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  36.21 
 
 		 466 aa  209  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  32.22 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  34.89 
 
 		 456 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  33.77 
 
 		 456 aa  206  9e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  33.83 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  35.05 
 
 		 453 aa  202  8e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  37.41 
 
 		 462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  34.66 
 
 		 499 aa  200  5e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  34.65 
 
 		 456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0778  anion transporter  34.46 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  31.53 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  31.53 
 
 		 534 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  32.23 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  34.32 
 
 		 459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  31.31 
 
 		 534 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  31.94 
 
 		 447 aa  189  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  36.9 
 
 		 460 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  37.14 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  28.82 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  30.45 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  31.58 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  27.93 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30.33 
 
 		 474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  30.57 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.81 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  30.13 
 
 		 472 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  29.98 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  29.32 
 
 		 471 aa  150  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  32.6 
 
 		 579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.33 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  28.99 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  25.78 
 
 		 446 aa  147  6e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  28.9 
 
 		 478 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  29.87 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3210  anion transporter  36.67 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  26.99 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.16 
 
 		 471 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  25.11 
 
 		 483 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  32.11 
 
 		 511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  26.36 
 
 		 461 aa  136  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  26.49 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.67 
 
 		 483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  26.75 
 
 		 514 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  27.59 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>